More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1506 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1506  ABC transporter related protein  100 
 
 		 258 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2062  heme exporter protein CcmA  69.61 
 
 		 205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569996  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4898  ABC transporter related  46.04 
 
 		 210 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4423  ABC transporter related  45.26 
 
 		 214 aa  161  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.993853  normal  0.857227 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2303  ABC transporter related protein  42.67 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  hitchhiker  0.00211545 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2334  ABC transporter related protein  45.93 
 
 		 232 aa  142  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00373453  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1601  ABC transporter related  49.71 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3779  ABC transporter related  42.86 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  39.34 
 
 		 303 aa  125  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1369  ABC transporter related  44.16 
 
 		 240 aa  125  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141351  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23410  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.65 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.166652 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3862  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.62 
 
 		 360 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000929662  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1434  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  38.6 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637096 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  35 
 
 		 243 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6343  ABC transporter related  34.25 
 
 		 274 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.279645 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  33.19 
 
 		 245 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1148  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  34.75 
 
 		 364 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  31.67 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  35.38 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1490  ABC transporter related  43.58 
 
 		 408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.513029  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.96 
 
 		 386 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  37.5 
 
 		 741 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1959  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  33.19 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1075  ATPase  38.16 
 
 		 324 aa  112  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.243658  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0983  ABC heme exporter, ATPase subunit  34.45 
 
 		 266 aa  112  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  36.15 
 
 		 756 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  37.73 
 
 		 547 aa  112  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.96 
 
 		 386 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  34.35 
 
 		 386 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  32.2 
 
 		 257 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  36.2 
 
 		 553 aa  112  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3635  ABC transporter related  36.19 
 
 		 322 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.501994  normal  0.045877 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.62 
 
 		 386 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6329  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  33.62 
 
 		 386 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.62 
 
 		 386 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4187  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  33.49 
 
 		 353 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205875  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1143  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  33.47 
 
 		 364 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.38 
 
 		 353 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  37.26 
 
 		 368 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1133  ABC transporter related  35.35 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.010872 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  32.49 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2303  ABC transporter related protein  30.88 
 
 		 246 aa  109  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000265903  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  36.4 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1262  ABC transporter related  34.02 
 
 		 245 aa  109  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000313912  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  35.58 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2684  ABC transporter related  38.16 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.924492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2278  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.67 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0320  ABC transporter related protein  36.89 
 
 		 382 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3013  ABC transporter related  39.15 
 
 		 284 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.46812  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  32.91 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  27.39 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  32.86 
 
 		 363 aa  108  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  34.56 
 
 		 240 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  31.62 
 
 		 377 aa  108  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1510  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.91 
 
 		 390 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  36.32 
 
 		 333 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1369  putrescine transporter ATP-binding subunit  31.2 
 
 		 377 aa  108  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1227  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.48 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0707636  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0516  ABC transporter related  34.67 
 
 		 216 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  37.95 
 
 		 256 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 		 381 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3439  ABC transporter related  35.89 
 
 		 322 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  35.03 
 
 		 365 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0213  ATPase  34.42 
 
 		 353 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2277  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.23 
 
 		 386 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273233  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  35.03 
 
 		 365 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  32.33 
 
 		 243 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  31.62 
 
 		 377 aa  108  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  31.62 
 
 		 377 aa  108  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  32.87 
 
 		 256 aa  108  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  31.62 
 
 		 377 aa  108  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  33.76 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1036  ABC transporter related protein  29.41 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  31.75 
 
 		 489 aa  108  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.19 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0462  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  29.86 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5561  ABC transporter related  37.61 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3815  ABC transporter related  37.6 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  37.74 
 
 		 267 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  30.28 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  32.84 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1572  ABC transporter ATP-binding protein  34.36 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  32.84 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  37.38 
 
 		 289 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1109  ABC transporter related  30.18 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4184  ABC transporter related protein  30.21 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.94 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  35.47 
 
 		 380 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2309  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.75 
 
 		 386 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1012  putrescine transporter ATP-binding subunit  31.62 
 
 		 377 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  31.02 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  32.39 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1534  ABC transporter related  33.47 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.261317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  36.27 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  29.49 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1787  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.75 
 
 		 386 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0108  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.75 
 
 		 386 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432666  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000214  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  30.9 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2178  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.75 
 
 		 386 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.455758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>