More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4898 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4898  ABC transporter related  100 
 
 
210 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000896239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4423  ABC transporter related  87.98 
 
 
214 aa  363  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.993853  normal  0.857227 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2062  heme exporter protein CcmA  50.27 
 
 
205 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569996  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1506  ABC transporter related protein  46.04 
 
 
258 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2334  ABC transporter related protein  45.95 
 
 
232 aa  137  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00373453  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1601  ABC transporter related  45.99 
 
 
238 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122919  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2303  ABC transporter related protein  41.71 
 
 
228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  hitchhiker  0.00211545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23410  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.85 
 
 
233 aa  126  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.166652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1369  ABC transporter related  43.24 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141351  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3779  ABC transporter related  36.11 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0149  ABC transporter-like protein  33.67 
 
 
343 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.661807  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1173  ABC transporter related  35.83 
 
 
239 aa  108  8.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.470964  normal  0.243393 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0367  ABC transporter related  30.73 
 
 
309 aa  107  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.1 
 
 
351 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  34.31 
 
 
250 aa  106  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  30.46 
 
 
241 aa  105  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4913  ABC transporter related  35.05 
 
 
383 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700005  normal  0.675349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  34.02 
 
 
343 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.02 
 
 
343 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.02 
 
 
343 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  34.72 
 
 
360 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.02 
 
 
340 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  33.85 
 
 
354 aa  104  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3243  ABC transporter related  34.92 
 
 
368 aa  104  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2841  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.81 
 
 
346 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0714016  normal  0.325359 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  31.63 
 
 
337 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  32.81 
 
 
330 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.46 
 
 
322 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 
338 aa  104  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2701  ABC transporter related  35.08 
 
 
241 aa  103  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128649  normal  0.0320572 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  32.11 
 
 
369 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  31.86 
 
 
250 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  40 
 
 
299 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  31.77 
 
 
352 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  31.08 
 
 
365 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12425  sulfate-transport ATP-binding protein ABC transporter cysA1  34.02 
 
 
351 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00408359  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2512  ABC transporter ATP-binding protein  32.11 
 
 
360 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408974  normal  0.94843 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  31.86 
 
 
250 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  34.55 
 
 
315 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  31.86 
 
 
250 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  35.26 
 
 
373 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0992  ABC transporter related  33.86 
 
 
328 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.360926 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  34.2 
 
 
360 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  31.86 
 
 
250 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  36.79 
 
 
534 aa  102  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  34.22 
 
 
323 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  31.05 
 
 
378 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  34.57 
 
 
338 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  34.38 
 
 
338 aa  102  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  34.03 
 
 
362 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3837  ABC transporter related  32.84 
 
 
253 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2416  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.14 
 
 
338 aa  102  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3356  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.83 
 
 
334 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2746  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.83 
 
 
334 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  34.57 
 
 
372 aa  101  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1154  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  33.17 
 
 
246 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3402  ABC transporter related  35.79 
 
 
245 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273251  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  30.58 
 
 
349 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3177  ABC transporter related  36.32 
 
 
245 aa  101  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3424  ABC transporter related  32.99 
 
 
328 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  32.81 
 
 
356 aa  101  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  33.5 
 
 
240 aa  101  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3680  ABC transporter related  35.08 
 
 
364 aa  101  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  31.05 
 
 
363 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  35.86 
 
 
356 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  32.65 
 
 
349 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2777  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.16 
 
 
332 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5458  ABC transporter related  35.79 
 
 
416 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1159  sulphate transport system permease protein 1  32.65 
 
 
348 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.64 
 
 
354 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  33.16 
 
 
370 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  34.03 
 
 
360 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1617  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  32.34 
 
 
247 aa  100  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000736916  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0701  ABC transporter related  31.94 
 
 
362 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  31.37 
 
 
250 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1708  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  31.68 
 
 
242 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.871153  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2713  ABC transporter related  31.96 
 
 
366 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  31.34 
 
 
241 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  33.85 
 
 
360 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  34.83 
 
 
876 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0546  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein ugpC  33.16 
 
 
338 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  30.85 
 
 
353 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0242  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  30.35 
 
 
249 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762427  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3724  ABC transporter related  32.99 
 
 
328 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  36.46 
 
 
305 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1048  sulphate transport system permease protein 1  32.14 
 
 
348 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  33.51 
 
 
366 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0922  ABC transporter related  33.62 
 
 
240 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.36 
 
 
226 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  31.94 
 
 
316 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  33.5 
 
 
243 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  33.51 
 
 
368 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  33.51 
 
 
301 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  33.51 
 
 
368 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  31.05 
 
 
364 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  32.11 
 
 
318 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  32.11 
 
 
318 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  32.99 
 
 
357 aa  99.8  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  30.89 
 
 
365 aa  99.4  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  32.46 
 
 
346 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>