More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1601 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1601  ABC transporter related  100 
 
 		 238 aa  459  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2303  ABC transporter related protein  63.23 
 
 		 228 aa  258  6e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  hitchhiker  0.00211545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23410  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.37 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.166652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2334  ABC transporter related protein  58.08 
 
 		 232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00373453  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1369  ABC transporter related  51.68 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141351  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3779  ABC transporter related  47.39 
 
 		 228 aa  186  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4423  ABC transporter related  45.36 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.993853  normal  0.857227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4898  ABC transporter related  45.99 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896239 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2062  heme exporter protein CcmA  49.71 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569996  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1506  ABC transporter related protein  49.71 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  40.94 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  38 
 
 		 326 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  40.35 
 
 		 304 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  35.55 
 
 		 304 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  35.21 
 
 		 553 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  35.14 
 
 		 351 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  35.14 
 
 		 351 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  40.35 
 
 		 304 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  39.77 
 
 		 304 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  39.77 
 
 		 304 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  37.77 
 
 		 306 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  37.77 
 
 		 304 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  37.77 
 
 		 304 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  37.77 
 
 		 304 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  37.77 
 
 		 304 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  34.68 
 
 		 344 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.38 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.09 
 
 		 322 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  35.21 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  30.54 
 
 		 335 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  39.77 
 
 		 373 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0671  ABC transporter related  26.64 
 
 		 310 aa  99.4  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0968  ABC transporter, ATP-binding protein  28.11 
 
 		 247 aa  99  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0958  ABC transporter, ATP-binding protein  28.11 
 
 		 247 aa  99  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0963  ABC transporter related  28.11 
 
 		 247 aa  99  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1125  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  28.11 
 
 		 247 aa  99  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  36.26 
 
 		 318 aa  99  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0815  ABC transporter-related protein  28.37 
 
 		 247 aa  99  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1152  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  28.11 
 
 		 247 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0979  ABC transporter ATP-binding protein EcsA  28.11 
 
 		 247 aa  98.6  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1048  ABC transporter ATP-binding protein  28.11 
 
 		 247 aa  98.6  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1213  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  28.11 
 
 		 247 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1084  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  28.11 
 
 		 247 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  36.26 
 
 		 318 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  36.26 
 
 		 318 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  36.26 
 
 		 318 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  37.04 
 
 		 252 aa  98.2  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4220  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  28.11 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.183421  normal  0.0669124 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  34.5 
 
 		 317 aa  97.8  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  36.84 
 
 		 315 aa  98.2  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  33.33 
 
 		 318 aa  97.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1767  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  35.5 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  36.32 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  34.52 
 
 		 322 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  34.36 
 
 		 303 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  34.5 
 
 		 346 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  34.5 
 
 		 346 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  29.53 
 
 		 323 aa  96.7  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  36.36 
 
 		 355 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  34.5 
 
 		 346 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  33.8 
 
 		 318 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  37.5 
 
 		 311 aa  96.3  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  37.06 
 
 		 318 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  32.12 
 
 		 313 aa  95.9  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 		 265 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 		 265 aa  95.5  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 		 265 aa  95.5  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 		 265 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 		 288 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 		 288 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 		 265 aa  95.5  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 		 288 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  35.75 
 
 		 342 aa  95.1  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  35.23 
 
 		 327 aa  95.1  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  30.05 
 
 		 323 aa  95.1  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  34.16 
 
 		 484 aa  95.1  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0645  ABC transporter related  28.29 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 327 aa  94.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  36.22 
 
 		 304 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0373  ABC transporter, ATP-binding protein  28.02 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  32.02 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  31.21 
 
 		 315 aa  94  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4132  ABC transporter related  37.37 
 
 		 328 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  34.18 
 
 		 320 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  30.65 
 
 		 312 aa  94  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  30.46 
 
 		 241 aa  93.6  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  36.47 
 
 		 323 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  33.52 
 
 		 326 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  30.89 
 
 		 387 aa  93.2  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  30.3 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  36.47 
 
 		 323 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2598  ABC transporter related  33.17 
 
 		 375 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375786  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  31.44 
 
 		 326 aa  93.2  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1572  ABC transporter ATP-binding protein  31.98 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2604  ABC transporter related  33.17 
 
 		 375 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  35.8 
 
 		 326 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  36.84 
 
 		 249 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2559  ABC transporter related  33.17 
 
 		 375 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  31.94 
 
 		 292 aa  92.4  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  34.92 
 
 		 308 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>