More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23410 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_23410  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 233 aa  441  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.166652 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1601  ABC transporter related  57.78 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2303  ABC transporter related protein  59.73 
 
 		 228 aa  233  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  hitchhiker  0.00211545 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2334  ABC transporter related protein  52.89 
 
 		 232 aa  198  7e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00373453  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1369  ABC transporter related  50.66 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141351  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3779  ABC transporter related  47.09 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4423  ABC transporter related  41.45 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.993853  normal  0.857227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4898  ABC transporter related  41.36 
 
 		 210 aa  128  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896239 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  36.61 
 
 		 1017 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  34.55 
 
 		 921 aa  115  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  38.42 
 
 		 1082 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  38.42 
 
 		 1066 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  38.42 
 
 		 1071 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  38.42 
 
 		 1089 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  38.42 
 
 		 1071 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  38.42 
 
 		 1079 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  35.9 
 
 		 336 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2142  ABC transporter related  39.77 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1506  ABC transporter related protein  43.65 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  38.42 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  32.64 
 
 		 340 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  35.22 
 
 		 918 aa  109  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  35.18 
 
 		 319 aa  109  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  36.04 
 
 		 922 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  35.96 
 
 		 308 aa  108  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  32.52 
 
 		 921 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  33.68 
 
 		 326 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  29.02 
 
 		 309 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  37.24 
 
 		 756 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  30.57 
 
 		 335 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  33.51 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  35.96 
 
 		 303 aa  106  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.62 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  36.46 
 
 		 341 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  32.65 
 
 		 326 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  28.8 
 
 		 318 aa  105  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  39.27 
 
 		 314 aa  105  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  36.04 
 
 		 936 aa  105  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  28.5 
 
 		 309 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  28.5 
 
 		 309 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  36.04 
 
 		 936 aa  105  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  28.5 
 
 		 309 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  29.02 
 
 		 321 aa  104  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  28.5 
 
 		 309 aa  104  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  33.16 
 
 		 318 aa  104  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  34.2 
 
 		 930 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  28.5 
 
 		 309 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1205  ABC transporter related  31.75 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00183606  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  35.98 
 
 		 304 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  35.98 
 
 		 304 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  35.98 
 
 		 326 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1572  ABC transporter ATP-binding protein  31.49 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  34.85 
 
 		 373 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  28.5 
 
 		 309 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0367  ABC transporter related  29.03 
 
 		 309 aa  104  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  33.85 
 
 		 927 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2135  ABC transporter related protein  35.94 
 
 		 355 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  35.98 
 
 		 304 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  35.98 
 
 		 304 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  34.76 
 
 		 316 aa  103  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  36.52 
 
 		 311 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  32.04 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  29.02 
 
 		 309 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  29.69 
 
 		 317 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  27.7 
 
 		 257 aa  102  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  38.19 
 
 		 310 aa  102  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  38.07 
 
 		 919 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4874  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.68 
 
 		 360 aa  102  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.368971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  39.47 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  32.49 
 
 		 933 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  32.6 
 
 		 930 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  29.95 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  32.99 
 
 		 321 aa  101  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2062  heme exporter protein CcmA  46.77 
 
 		 205 aa  101  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569996  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  31.49 
 
 		 930 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  35.43 
 
 		 936 aa  101  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  33.33 
 
 		 929 aa  101  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.88 
 
 		 338 aa  102  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  29.15 
 
 		 244 aa  101  9e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  37.99 
 
 		 741 aa  101  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  32.99 
 
 		 914 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  38.42 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  34.39 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  36.7 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  36.7 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  35.56 
 
 		 327 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0216  ABC transporter related  41.62 
 
 		 308 aa  100  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  34.54 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.89 
 
 		 322 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1502  ABC transporter related  32.4 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  38.42 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  34.2 
 
 		 911 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  31.34 
 
 		 481 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  35.45 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  31.33 
 
 		 924 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  37.72 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  37.72 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  35.45 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  37.72 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  35.45 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>