More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1133 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1133  ABC transporter related  100 
 
 		 259 aa  507  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2071  ABC transporter related  54.41 
 
 		 230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2834  ABC transporter related  51.14 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.698538  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  49.07 
 
 		 369 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1148  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.25 
 
 		 364 aa  216  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  48.9 
 
 		 353 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1143  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.25 
 
 		 364 aa  215  7e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.69 
 
 		 373 aa  215  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  45.12 
 
 		 356 aa  215  7e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.26 
 
 		 402 aa  214  9e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  48.02 
 
 		 353 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.77 
 
 		 362 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  48.87 
 
 		 352 aa  212  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  47.58 
 
 		 353 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  46.7 
 
 		 353 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  47.58 
 
 		 353 aa  210  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  48.18 
 
 		 366 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1610  ABC transporter ATP-binding protein  43.23 
 
 		 318 aa  208  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.07 
 
 		 360 aa  208  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1734  ABC transporter ATP-binding protein  43.23 
 
 		 318 aa  208  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3591  ABC transporter, ATP-binding protein  44.2 
 
 		 330 aa  208  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1785  ABC transporter, ATP-binding protein  43.23 
 
 		 330 aa  208  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1752  ABC transporter, ATP-binding protein  44.2 
 
 		 330 aa  208  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  47.14 
 
 		 383 aa  207  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1811  ABC transporter, ATP-binding protein  44.2 
 
 		 330 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1865  ABC transporter, ATP-binding protein  44.2 
 
 		 330 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  46.9 
 
 		 365 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1610  ABC transporter related  42.79 
 
 		 330 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054116  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.54 
 
 		 370 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.92 
 
 		 372 aa  207  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1571  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 330 aa  206  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1562  ABC transporter, ATP-binding protein  43.23 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37727  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1222  ABC transporter related  51.32 
 
 		 230 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4003  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.98 
 
 		 365 aa  206  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4615  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.63 
 
 		 374 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0562  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  44.63 
 
 		 374 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0149  ABC transporter-like protein  46.9 
 
 		 343 aa  206  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.661807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  45.58 
 
 		 342 aa  205  6e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.06 
 
 		 371 aa  205  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.92 
 
 		 352 aa  205  6e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4133  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.74 
 
 		 346 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1587  ABC transporter related  48.15 
 
 		 366 aa  205  6e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0179  ABC transporter related  46.32 
 
 		 388 aa  205  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1484  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  45.18 
 
 		 343 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  0.0950127 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  42.42 
 
 		 348 aa  204  9e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1090  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.29 
 
 		 369 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460702  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.73 
 
 		 373 aa  204  9e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  46.7 
 
 		 353 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5125  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.21 
 
 		 374 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0754257  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.18 
 
 		 343 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.391608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1841  ABC transporter related  45.37 
 
 		 361 aa  204  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0411  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  44.73 
 
 		 374 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0809  ABC transporter, ATP-binding protein  45.58 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0759  ABC transporter, ATP-binding protein  45.58 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.850542  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0445  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.73 
 
 		 374 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  47.22 
 
 		 349 aa  203  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.3 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  45.37 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  42.98 
 
 		 358 aa  203  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  43.04 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  49.75 
 
 		 358 aa  202  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  49.75 
 
 		 358 aa  202  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3424  ABC transporter related  46.4 
 
 		 328 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  45.05 
 
 		 350 aa  202  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  47.51 
 
 		 363 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.7 
 
 		 367 aa  202  3e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  41.56 
 
 		 348 aa  202  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.12 
 
 		 337 aa  202  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  51.42 
 
 		 358 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  44.4 
 
 		 353 aa  202  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1047  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.16 
 
 		 345 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330018  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  48.83 
 
 		 360 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.6 
 
 		 352 aa  202  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0442  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.73 
 
 		 374 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.826065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  48.83 
 
 		 360 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  41.05 
 
 		 367 aa  202  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  47.91 
 
 		 359 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.4 
 
 		 399 aa  202  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1849  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.78 
 
 		 381 aa  202  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3616  ABC transporter related  47.09 
 
 		 356 aa  201  7e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  49.76 
 
 		 384 aa  201  7e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.92 
 
 		 353 aa  201  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4791  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.36 
 
 		 374 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.39 
 
 		 366 aa  201  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  43.04 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3863  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.94 
 
 		 359 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7453  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  47.39 
 
 		 347 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2913  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.64 
 
 		 369 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1511  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  48.87 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280689  normal  0.146459 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1646  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.65 
 
 		 363 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  42.04 
 
 		 386 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  42.79 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3121  ABC transporter related  48.89 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3724  ABC transporter related  45.95 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0568  ABC transporter related  40.17 
 
 		 363 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0218426  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.36 
 
 		 380 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6149  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.42 
 
 		 360 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1061  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.24 
 
 		 382 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000354755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  47.44 
 
 		 363 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.58 
 
 		 357 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>