More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2114 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2114  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 363 aa  695    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 440 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  29.05 
 
 		 437 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  29.74 
 
 		 438 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  29.15 
 
 		 439 aa  155  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 458 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 461 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.26 
 
 		 437 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 456 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 439 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 455 aa  146  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  26.76 
 
 		 459 aa  146  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.43 
 
 		 438 aa  146  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 439 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 457 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 454 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.74 
 
 		 437 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  27.34 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 438 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 442 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 459 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 439 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 439 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 439 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3969  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 457 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 439 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 439 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 439 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  27.32 
 
 		 450 aa  139  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 439 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  26.96 
 
 		 468 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 439 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 461 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  27.51 
 
 		 484 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2535  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 439 aa  135  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.70915 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 435 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 435 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 435 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  28.81 
 
 		 443 aa  135  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  26.43 
 
 		 447 aa  135  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  26.01 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  26.01 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  27.25 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  26.01 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  25 
 
 		 456 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  24 
 
 		 457 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  24 
 
 		 457 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  24 
 
 		 457 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 465 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  29.12 
 
 		 460 aa  133  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  27.21 
 
 		 439 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 439 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  26.79 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  25.6 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  27.56 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5957  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0570513 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  26.98 
 
 		 435 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  26.98 
 
 		 435 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  25.84 
 
 		 438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  28.49 
 
 		 443 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 439 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 454 aa  129  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  29.87 
 
 		 452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  28.16 
 
 		 459 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  26.53 
 
 		 465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  29.04 
 
 		 463 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  25.93 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  25.66 
 
 		 435 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  25.66 
 
 		 435 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  25.36 
 
 		 438 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  25.66 
 
 		 435 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  25.36 
 
 		 438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  25.36 
 
 		 438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  25.36 
 
 		 438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  25.36 
 
 		 438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  27.88 
 
 		 482 aa  126  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  25.36 
 
 		 438 aa  126  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  27.15 
 
 		 435 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 433 aa  126  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  25.63 
 
 		 439 aa  126  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  25.67 
 
 		 438 aa  126  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 		 432 aa  123  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  27.55 
 
 		 429 aa  122  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267941 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0130  general substrate transporter  29.02 
 
 		 441 aa  122  8e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.471024  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 452 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  28.12 
 
 		 441 aa  122  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  25.4 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2261  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0193  major facilitator family transporter  28.96 
 
 		 422 aa  120  3e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  28.42 
 
 		 460 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 456 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  25.61 
 
 		 452 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 441 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 452 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1044  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 443 aa  117  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  28.1 
 
 		 430 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>