93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4423 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4423  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 		 231 aa  470  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4815  cytoplasmic chaperone TorD family protein  89.61 
 
 		 230 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0057  cytoplasmic chaperone TorD family protein  83.98 
 
 		 221 aa  400  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4139  cytoplasmic chaperone TorD family protein  83.55 
 
 		 224 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  80 
 
 		 225 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  80 
 
 		 225 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  80 
 
 		 225 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4134  cytoplasmic chaperone TorD family protein  79.13 
 
 		 225 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  85.99 
 
 		 225 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4507  TorA specific chaperone, putative  85.51 
 
 		 225 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3914  cytoplasmic chaperone TorD family protein  85.02 
 
 		 225 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3718  cytoplasmic chaperone TorD family protein  85.02 
 
 		 225 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3789  cytoplasmic chaperone TorD family protein  84.54 
 
 		 225 aa  371  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3615  TorA specific chaperone, putative  75.34 
 
 		 221 aa  349  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  79.71 
 
 		 221 aa  341  5e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02275  hypothetical protein  50.56 
 
 		 210 aa  186  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003496  putative formate dehydrogenase-specific chaperone  48.22 
 
 		 208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1451  putative cytoplasmic chaperone TorD  48.17 
 
 		 203 aa  178  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1122  putative chaperone, formate dehydrogenase-specific  46.07 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1913  cytoplasmic chaperone TorD  47.37 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.25 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.25 
 
 		 211 aa  146  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2375  hypothetical protein  43.22 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953085 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.71 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451099  normal  0.0871667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2588  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.71 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.138506 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0502  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.82 
 
 		 220 aa  135  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0680  cytoplasmic chaperone TorD  41.27 
 
 		 210 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2763  cytoplasmic chaperone TorD  40 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0399  cytoplasmic chaperone TorD  36.65 
 
 		 208 aa  132  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.372302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3124  cytoplasmic chaperone TorD  40.66 
 
 		 260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3201  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.47 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.634799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.13 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.55 
 
 		 207 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5493  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.38 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.27 
 
 		 201 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.76 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2793  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.04 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.588272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3466  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.04 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.74555  normal  0.35285 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4064  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.83 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1167  hypothetical protein  38.1 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2447  cytoplasmic chaperone TorD  36.76 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0935  cytoplasmic chaperone TorD  36.5 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3263  cytoplasmic chaperone TorD  35.45 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.852314  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3733  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1399  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.17 
 
 		 216 aa  99.4  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3711  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.69 
 
 		 215 aa  99  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680187  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0833  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37 
 
 		 204 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  24.41 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  26.15 
 
 		 209 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  24.41 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  25.64 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  25.64 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.39 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  25.13 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  23.44 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.27 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  25.82 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  22.37 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.77 
 
 		 221 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1834  chaperone protein TorD  21.43 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  23.47 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  21.54 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  22.77 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.17 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1231  chaperone protein TorD  23.76 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.7 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  24.75 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.83 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1115  chaperone protein TorD  23.27 
 
 		 209 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.3 
 
 		 231 aa  48.5  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1054  chaperone protein TorD  23.27 
 
 		 209 aa  48.5  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  26.36 
 
 		 209 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1050  chaperone protein TorD  23.27 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  23.5 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.38 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.78 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  23.39 
 
 		 936 aa  47  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27.13 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.17 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1674  chaperone protein TorD  20.18 
 
 		 193 aa  44.3  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00649542  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0360  Putative anaerobic dehydrogenase-like component  24.09 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.36 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  22.34 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.74 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.27 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.47 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.38 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2799  chaperone protein TorD  22.73 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.011442 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  20.59 
 
 		 226 aa  42.7  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1284  cytoplasmic chaperone TorD  27.34 
 
 		 203 aa  42  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  24.62 
 
 		 252 aa  41.6  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2606  hypothetical protein  27.8 
 
 		 280 aa  41.6  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.584677 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3382  cytoplasmic chaperone TorD  27.82 
 
 		 224 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260043  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>