124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3361 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  100 
 
 		 215 aa  441  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  77.83 
 
 		 223 aa  329  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  66.82 
 
 		 221 aa  295  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  57.08 
 
 		 218 aa  250  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  59.9 
 
 		 204 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  59.41 
 
 		 209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  59.41 
 
 		 209 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  58.42 
 
 		 209 aa  238  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1054  chaperone protein TorD  59.11 
 
 		 209 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1115  chaperone protein TorD  59.61 
 
 		 209 aa  234  8e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1231  chaperone protein TorD  57.64 
 
 		 217 aa  231  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1050  chaperone protein TorD  58.62 
 
 		 209 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2799  chaperone protein TorD  51.17 
 
 		 211 aa  214  9e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.011442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1834  chaperone protein TorD  45.07 
 
 		 236 aa  178  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0986  chaperone protein TorD  38.03 
 
 		 235 aa  131  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  37.44 
 
 		 215 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  37.68 
 
 		 220 aa  114  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  37.25 
 
 		 215 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  31.19 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2316  chaperone protein TorD  33.16 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1234  chaperone protein TorD  32.98 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.713682  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01001  chaperone protein TorD  32.98 
 
 		 199 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1109  chaperone protein TorD  32.98 
 
 		 199 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01008  hypothetical protein  32.98 
 
 		 199 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2644  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.98 
 
 		 199 aa  89  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.437385  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2597  chaperone protein TorD  32.98 
 
 		 199 aa  89  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.382681 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1116  chaperone protein TorD  32.46 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2126  chaperone protein TorD  32.98 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2732  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.85 
 
 		 237 aa  85.9  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4032  chaperone protein TorD  32.85 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4049  chaperone protein TorD  34.74 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.22 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4211  chaperone protein TorD  34.21 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4104  chaperone protein TorD  33.68 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4153  chaperone protein TorD  33.68 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.39248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.85 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  26.54 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1674  chaperone protein TorD  33.77 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00649542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.52 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1876  cytoplasmic chaperone TorD  26.77 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.46 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.54 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.46 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  26.7 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.13 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.37 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.73 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2052  TorD family cytoplasmic chaperone  31.44 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2445  TorD family cytoplasmic chaperone  31.44 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2164  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.44 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.063946  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.49 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.5 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.5 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.5 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.29 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.88 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  24.88 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.05 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.85 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1198  anaerobic dehydrogenase protein-like protein  24.55 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3914  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.12 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4423  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.47 
 
 		 231 aa  51.6  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3615  TorA specific chaperone, putative  23.98 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4134  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.33 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1122  putative chaperone, formate dehydrogenase-specific  28.26 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  22.69 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4217  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.66 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.154602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3718  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.86 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.63 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.07 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4815  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.84 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.91 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.01 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.07 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3789  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.86 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0057  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.98 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1935  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.98 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161527  hitchhiker  0.00430197 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0680  cytoplasmic chaperone TorD  25.46 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.14 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1413  chaperone, TorD family  25.91 
 
 		 184 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753019 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01032  hypothetical protein  25.91 
 
 		 184 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.77975  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01039  hypothetical protein  25.91 
 
 		 184 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1153  chaperone TorD  25.91 
 
 		 184 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120482  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1154  chaperone TorD  25.91 
 
 		 184 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2294  chaperone, TorD family  25.91 
 
 		 184 aa  48.5  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.250336  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.14 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.56 
 
 		 226 aa  48.1  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4507  TorA specific chaperone, putative  23.35 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  26.97 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.4 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0657  DMSO-membrane protein  31.71 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.527505 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2610  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.39 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000111004  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18510  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.28 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4139  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.96 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2564  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.39 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.241969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2098  chaperone TorD  26.42 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.41 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  23.08 
 
 		 252 aa  46.2  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.69 
 
 		 221 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>