128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22800 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  100 
 
 
239 aa  479  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  61.82 
 
 
236 aa  293  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  55.76 
 
 
231 aa  250  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  53.46 
 
 
244 aa  237  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  49.35 
 
 
252 aa  230  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  51.83 
 
 
226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  50.46 
 
 
250 aa  218  8.999999999999998e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  47.42 
 
 
225 aa  194  8.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.32 
 
 
222 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.32 
 
 
225 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  32.5 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05620  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  33.89 
 
 
242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  36.15 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.77 
 
 
231 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  30.21 
 
 
236 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1590  hypothetical protein  31.28 
 
 
229 aa  93.2  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531622 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.2 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3682  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.35 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.966559  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  28.7 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  26.03 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  27.4 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1182  hypothetical protein  27.65 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.49 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.84 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.47 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.33 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.81 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1982  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  35.17 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.334911  hitchhiker  0.00497419 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.64 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.56 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2104  cytoplasmic chaperone  30.82 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1068  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  35.17 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.685316  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1609  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.92 
 
 
284 aa  68.6  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1494  hypothetical protein  30.52 
 
 
205 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.97 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.38 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  25.66 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.51 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.89 
 
 
219 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.18 
 
 
219 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.5 
 
 
221 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30.22 
 
 
225 aa  63.2  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.683662  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  24.89 
 
 
223 aa  62  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1431  hypothetical protein  30.43 
 
 
221 aa  60.1  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18510  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30.34 
 
 
230 aa  59.7  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.9 
 
 
214 aa  58.9  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3091  hypothetical protein  30.35 
 
 
236 aa  58.5  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.697478  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3661  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.11 
 
 
210 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.11 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.98 
 
 
241 aa  57.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.07 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.26 
 
 
238 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0240  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.57 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00630  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.57 
 
 
116 aa  57.4  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2581  hypothetical protein  34.62 
 
 
237 aa  56.6  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.173611  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2921  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.95 
 
 
218 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0546  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.77 
 
 
219 aa  56.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.5 
 
 
219 aa  55.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1651  anaerobic dehydrogenase-like protein  31.06 
 
 
270 aa  55.1  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1122  putative chaperone, formate dehydrogenase-specific  30.71 
 
 
223 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.71 
 
 
195 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.42 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1050  chaperone protein TorD  26.61 
 
 
209 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1054  chaperone protein TorD  26.15 
 
 
209 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2354  anaerobic dehydrogenase-like protein  25.71 
 
 
210 aa  52.4  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  25.23 
 
 
209 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1115  chaperone protein TorD  25.55 
 
 
209 aa  52  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4213  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.69 
 
 
195 aa  52  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1231  chaperone protein TorD  25 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1674  chaperone protein TorD  29.77 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00649542  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1192  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.17 
 
 
285 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.563307  normal  0.32454 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1866  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.82 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0320246 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  29.94 
 
 
209 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0951  hypothetical protein  27.74 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.180933  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.71 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  25.47 
 
 
209 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  22.69 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.49 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1338  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.79 
 
 
193 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1198  anaerobic dehydrogenase protein-like protein  28.5 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.09 
 
 
221 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  25.47 
 
 
209 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2380  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.67 
 
 
232 aa  50.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.434719 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  25.47 
 
 
204 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2368  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.94 
 
 
234 aa  49.7  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.447639  normal  0.379865 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1876  cytoplasmic chaperone TorD  29.32 
 
 
213 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2375  hypothetical protein  26.92 
 
 
223 aa  49.3  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00953085 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  21.56 
 
 
218 aa  49.3  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2732  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.97 
 
 
237 aa  49.3  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.24 
 
 
219 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1406  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.08 
 
 
206 aa  48.5  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2045  hypothetical protein  31.82 
 
 
199 aa  48.5  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.362778  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4217  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.21 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.154602  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0197  delta-subunit of ethylbenzene dehydrogenase  27.7 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.86 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0935  cytoplasmic chaperone TorD  29.7 
 
 
205 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3201  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.3 
 
 
200 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.634799  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  28.95 
 
 
186 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  29.01 
 
 
186 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4064  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.79 
 
 
205 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>