58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4217 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4217  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 		 212 aa  430  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.154602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  36.53 
 
 		 220 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  33.49 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4032  chaperone protein TorD  33.51 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2126  chaperone protein TorD  35.2 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1234  chaperone protein TorD  34.69 
 
 		 199 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.713682  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2644  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.69 
 
 		 199 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.437385  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4153  chaperone protein TorD  33.51 
 
 		 210 aa  97.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.39248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4104  chaperone protein TorD  33.51 
 
 		 210 aa  97.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4211  chaperone protein TorD  33.51 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4049  chaperone protein TorD  33.68 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2316  chaperone protein TorD  34.18 
 
 		 199 aa  96.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1116  chaperone protein TorD  34.18 
 
 		 199 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  32.21 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01008  hypothetical protein  34.18 
 
 		 199 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01001  chaperone protein TorD  34.18 
 
 		 199 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1109  chaperone protein TorD  34.18 
 
 		 199 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  31.73 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2597  chaperone protein TorD  34.18 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.382681 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2732  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.84 
 
 		 237 aa  89  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1834  chaperone protein TorD  29.07 
 
 		 236 aa  86.7  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.67 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1054  chaperone protein TorD  31.86 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1050  chaperone protein TorD  32.2 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1115  chaperone protein TorD  31.71 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  30.26 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1231  chaperone protein TorD  29.7 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  30.26 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  29.74 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2799  chaperone protein TorD  32.16 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.011442 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  29.74 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  29.61 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  30.73 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  28.93 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1494  hypothetical protein  27.4 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.46 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1750  cytoplasmic chaperone TorD  25.13 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  26.57 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1674  chaperone protein TorD  31.2 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00649542  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0986  chaperone protein TorD  29.73 
 
 		 235 aa  51.6  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.8 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1182  hypothetical protein  23.41 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1068  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  31.16 
 
 		 178 aa  49.3  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.685316  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3382  cytoplasmic chaperone TorD  23.98 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.66 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1198  anaerobic dehydrogenase protein-like protein  26.29 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.88 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  27.46 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1982  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.1 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.334911  hitchhiker  0.00497419 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  24.11 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  27.35 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.58 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1876  cytoplasmic chaperone TorD  28.24 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  30.17 
 
 		 936 aa  42.4  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3047  DMSO-membrane protein  33.85 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1284  cytoplasmic chaperone TorD  37.14 
 
 		 203 aa  42  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3774  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.85 
 
 		 226 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.416622  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>