57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1182 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1182  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1494  hypothetical protein  37.56 
 
 
205 aa  161  6e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1982  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  34.18 
 
 
181 aa  107  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.334911  hitchhiker  0.00497419 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1068  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  33.16 
 
 
178 aa  103  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.685316  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.7 
 
 
252 aa  85.5  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  28.02 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  28.31 
 
 
236 aa  82  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.65 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.17 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.8 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.53 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  24.88 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1794  hypothetical protein  24.87 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.453303  hitchhiker  0.00946321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0512  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase-like protein  31.15 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  32.67 
 
 
236 aa  72  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.35 
 
 
222 aa  72  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.36 
 
 
226 aa  72  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2174  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase-like protein  25.14 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  hitchhiker  0.00000531881 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.06 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.85 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  23 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.87 
 
 
250 aa  64.3  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.78 
 
 
225 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  25.69 
 
 
226 aa  63.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.05 
 
 
233 aa  62.4  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  23.74 
 
 
220 aa  59.7  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.03 
 
 
234 aa  58.9  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.76 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1590  hypothetical protein  26.58 
 
 
229 aa  55.1  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531622 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.56 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1651  anaerobic dehydrogenase-like protein  30 
 
 
270 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05620  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.87 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1198  anaerobic dehydrogenase protein-like protein  25.48 
 
 
223 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0388  hypothetical protein  23.12 
 
 
280 aa  52.4  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18510  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.05 
 
 
230 aa  52  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3091  hypothetical protein  31.19 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.697478  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00630  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  32 
 
 
116 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17900  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.256689  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.71 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.82 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.68 
 
 
219 aa  50.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.24 
 
 
195 aa  48.5  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.12 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.78 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.67 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.22 
 
 
229 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2104  cytoplasmic chaperone  31.48 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  21.72 
 
 
238 aa  45.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4217  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.22 
 
 
212 aa  45.1  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.154602  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2606  hypothetical protein  22.94 
 
 
280 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.584677 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  23.83 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.9 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  23.25 
 
 
218 aa  42.4  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26 
 
 
237 aa  42  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  21.77 
 
 
229 aa  41.6  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  21.85 
 
 
221 aa  41.6  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2354  anaerobic dehydrogenase-like protein  28.57 
 
 
210 aa  41.6  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>