49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1494 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1494  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  417  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1182  hypothetical protein  37.56 
 
 
214 aa  161  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1068  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.59 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.685316  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1982  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.86 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.334911  hitchhiker  0.00497419 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.48 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  28.85 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30.52 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1794  hypothetical protein  31.97 
 
 
347 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.453303  hitchhiker  0.00946321 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  28.37 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2174  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase-like protein  31.15 
 
 
349 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  hitchhiker  0.00000531881 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.07 
 
 
225 aa  62  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0512  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase-like protein  30.19 
 
 
313 aa  62  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.85 
 
 
252 aa  60.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1651  anaerobic dehydrogenase-like protein  28.04 
 
 
270 aa  58.9  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.97 
 
 
226 aa  58.9  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.75 
 
 
225 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0240  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.34 
 
 
204 aa  54.7  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.38 
 
 
222 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.84 
 
 
244 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  28.1 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  24 
 
 
236 aa  52.8  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.81 
 
 
234 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.89 
 
 
231 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  24.43 
 
 
215 aa  52.4  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18510  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  32 
 
 
230 aa  51.6  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.12 
 
 
233 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4217  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.94 
 
 
212 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.154602  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.47 
 
 
250 aa  48.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17900  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  36.36 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.256689  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4213  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.55 
 
 
195 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  24.55 
 
 
215 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  25.71 
 
 
186 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  25.71 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  25.71 
 
 
186 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  25.71 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  25.71 
 
 
186 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.49 
 
 
212 aa  45.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1198  anaerobic dehydrogenase protein-like protein  27.5 
 
 
223 aa  45.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0816  hypothetical protein  25.52 
 
 
220 aa  45.4  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.192641  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00630  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.92 
 
 
116 aa  45.1  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.94 
 
 
228 aa  45.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  26.67 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4222  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000173102  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.67 
 
 
211 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1899  hypothetical protein  37.25 
 
 
212 aa  42.4  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2547  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.27 
 
 
199 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0265649  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3091  hypothetical protein  34.38 
 
 
236 aa  42  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.697478  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1563  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.13 
 
 
226 aa  42  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.548826  normal  0.822991 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  25.53 
 
 
215 aa  41.6  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>