113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16920 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  100 
 
 
252 aa  515  1.0000000000000001e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  54.46 
 
 
236 aa  259  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  50 
 
 
231 aa  224  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  49.09 
 
 
239 aa  223  3e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  46.43 
 
 
244 aa  210  2e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  46.26 
 
 
226 aa  203  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  43.4 
 
 
250 aa  190  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.53 
 
 
225 aa  159  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.26 
 
 
222 aa  142  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.84 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  31.65 
 
 
231 aa  109  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  42.14 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1590  hypothetical protein  30.91 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531622 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.72 
 
 
231 aa  92  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  29.55 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05620  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  31.42 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.28 
 
 
233 aa  89.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.76 
 
 
225 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1182  hypothetical protein  28.7 
 
 
214 aa  85.5  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.72 
 
 
213 aa  85.5  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.25 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.5 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.16 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.42 
 
 
229 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2606  hypothetical protein  31.03 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.584677 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  26.99 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.39 
 
 
195 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  25.45 
 
 
215 aa  64.3  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30.43 
 
 
225 aa  64.3  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.683662  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.83 
 
 
229 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.1 
 
 
211 aa  62.4  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18510  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.83 
 
 
230 aa  62.4  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.67 
 
 
214 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2354  anaerobic dehydrogenase-like protein  25.4 
 
 
210 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1494  hypothetical protein  26.85 
 
 
205 aa  60.8  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.06 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1982  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  31.88 
 
 
181 aa  60.1  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.334911  hitchhiker  0.00497419 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  24.26 
 
 
220 aa  60.1  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1068  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  31.88 
 
 
178 aa  60.1  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.685316  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0951  hypothetical protein  29.45 
 
 
192 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.180933  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.65 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.91 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.09 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.65 
 
 
219 aa  57  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1198  anaerobic dehydrogenase protein-like protein  26.19 
 
 
223 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3682  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.1 
 
 
219 aa  55.8  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.966559  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.65 
 
 
221 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.8 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0512  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase-like protein  29.91 
 
 
313 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  22.59 
 
 
221 aa  53.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  23.45 
 
 
215 aa  53.1  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0546  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.72 
 
 
219 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00630  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.89 
 
 
116 aa  52.8  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2581  hypothetical protein  30.21 
 
 
237 aa  52.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.173611  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.67 
 
 
210 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  24.11 
 
 
223 aa  52.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3091  hypothetical protein  27.32 
 
 
236 aa  52  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.697478  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2799  chaperone protein TorD  26.22 
 
 
211 aa  52  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.011442 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1122  putative chaperone, formate dehydrogenase-specific  28.21 
 
 
223 aa  52.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.6 
 
 
219 aa  52  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1651  anaerobic dehydrogenase-like protein  28.15 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1431  hypothetical protein  29.41 
 
 
221 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3661  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.06 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1192  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.09 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.563307  normal  0.32454 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.77 
 
 
190 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2104  cytoplasmic chaperone  26.63 
 
 
216 aa  50.1  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.81 
 
 
217 aa  48.9  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2921  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.48 
 
 
218 aa  48.9  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.44 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0388  hypothetical protein  26.82 
 
 
280 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  23.26 
 
 
218 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1167  hypothetical protein  25.59 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.94 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4064  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.65 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  26.56 
 
 
186 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2045  hypothetical protein  26.94 
 
 
199 aa  46.6  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.362778  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1050  chaperone protein TorD  26.22 
 
 
209 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2380  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.08 
 
 
232 aa  46.6  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.434719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  26.56 
 
 
186 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  28.12 
 
 
186 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  28.12 
 
 
186 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  24.88 
 
 
209 aa  46.2  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1406  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.75 
 
 
206 aa  46.2  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  23.08 
 
 
215 aa  46.2  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1115  chaperone protein TorD  26.82 
 
 
209 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1899  hypothetical protein  29.05 
 
 
212 aa  45.8  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2368  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30 
 
 
234 aa  45.4  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.447639  normal  0.379865 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1338  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.48 
 
 
193 aa  45.4  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  24.88 
 
 
209 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  25 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  25.37 
 
 
209 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  27.34 
 
 
186 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  24.88 
 
 
204 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1834  chaperone protein TorD  23.29 
 
 
236 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1876  cytoplasmic chaperone TorD  26.9 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0240  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.67 
 
 
204 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2174  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase-like protein  31.3 
 
 
349 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  hitchhiker  0.00000531881 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0335  hypothetical protein  27.27 
 
 
222 aa  44.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2471  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.47 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>