81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1167 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1167  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3733  cytoplasmic chaperone TorD family protein  60.68 
 
 		 214 aa  239  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4064  cytoplasmic chaperone TorD family protein  58.33 
 
 		 205 aa  224  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3466  cytoplasmic chaperone TorD family protein  56.5 
 
 		 212 aa  222  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.74555  normal  0.35285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2793  cytoplasmic chaperone TorD family protein  56.5 
 
 		 212 aa  222  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.588272  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0935  cytoplasmic chaperone TorD  54.04 
 
 		 205 aa  220  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3263  cytoplasmic chaperone TorD  51.69 
 
 		 207 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.852314  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0833  cytoplasmic chaperone TorD family protein  55.96 
 
 		 204 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2763  cytoplasmic chaperone TorD  50.96 
 
 		 217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2375  hypothetical protein  48.62 
 
 		 223 aa  191  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0680  cytoplasmic chaperone TorD  49.25 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  46.33 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451099  normal  0.0871667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2588  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.87 
 
 		 223 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.138506 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1399  cytoplasmic chaperone TorD family protein  46.11 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1451  putative cytoplasmic chaperone TorD  43.92 
 
 		 203 aa  151  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0502  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.71 
 
 		 220 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5493  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.29 
 
 		 235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3711  cytoplasmic chaperone TorD family protein  47.12 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680187  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.29 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1122  putative chaperone, formate dehydrogenase-specific  39.25 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02275  hypothetical protein  34.69 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3124  cytoplasmic chaperone TorD  40.84 
 
 		 260 aa  121  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.71 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4134  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.15 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3914  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.15 
 
 		 225 aa  118  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0399  cytoplasmic chaperone TorD  36.13 
 
 		 208 aa  118  7.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.372302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.15 
 
 		 225 aa  117  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003496  putative formate dehydrogenase-specific chaperone  34.36 
 
 		 208 aa  117  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.15 
 
 		 225 aa  117  9e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.15 
 
 		 225 aa  117  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3789  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.15 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3718  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.15 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4423  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.1 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.62 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0057  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.17 
 
 		 221 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3615  TorA specific chaperone, putative  38.71 
 
 		 221 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2447  cytoplasmic chaperone TorD  42.49 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206479  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4507  TorA specific chaperone, putative  38.1 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.5 
 
 		 211 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.5 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4815  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.79 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4139  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.63 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.61 
 
 		 211 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.2 
 
 		 201 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3201  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.94 
 
 		 200 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.634799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  44.44 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1913  cytoplasmic chaperone TorD  35.2 
 
 		 235 aa  92.8  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  25.62 
 
 		 236 aa  53.9  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  26.13 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.33 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.17 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2606  hypothetical protein  28.05 
 
 		 280 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.584677 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  23.81 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  28.1 
 
 		 936 aa  48.1  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.19 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.59 
 
 		 252 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  35.16 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.33 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3864  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.56 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0799961  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.8 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  29.55 
 
 		 226 aa  45.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  24.14 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2380  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.48 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.434719 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.64 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.87 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.5 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.46 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1431  hypothetical protein  25.18 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.36 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3047  DMSO-membrane protein  26.06 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.08 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  24.38 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  23.5 
 
 		 239 aa  42.4  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.51 
 
 		 217 aa  42  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  26.73 
 
 		 220 aa  42  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0356  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.81 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0328008  hitchhiker  0.00751458 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2164  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.03 
 
 		 186 aa  41.6  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.063946  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2445  TorD family cytoplasmic chaperone  29.03 
 
 		 186 aa  41.6  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2052  TorD family cytoplasmic chaperone  29.03 
 
 		 186 aa  41.6  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3774  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.06 
 
 		 226 aa  41.6  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.416622  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>