71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1913 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1913  cytoplasmic chaperone TorD  100 
 
 
235 aa  477  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  47.06 
 
 
221 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0057  cytoplasmic chaperone TorD family protein  47.57 
 
 
221 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4423  cytoplasmic chaperone TorD family protein  47.37 
 
 
231 aa  168  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  48.35 
 
 
225 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  48.35 
 
 
225 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  48.35 
 
 
225 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4507  TorA specific chaperone, putative  48.89 
 
 
225 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3615  TorA specific chaperone, putative  45.99 
 
 
221 aa  167  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4139  cytoplasmic chaperone TorD family protein  47.89 
 
 
224 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  47.83 
 
 
225 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4134  cytoplasmic chaperone TorD family protein  47.8 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4815  cytoplasmic chaperone TorD family protein  46.84 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3914  cytoplasmic chaperone TorD family protein  46.49 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003496  putative formate dehydrogenase-specific chaperone  44.69 
 
 
208 aa  162  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02275  hypothetical protein  42.46 
 
 
210 aa  162  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3789  cytoplasmic chaperone TorD family protein  47.78 
 
 
225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3718  cytoplasmic chaperone TorD family protein  47.78 
 
 
225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1122  putative chaperone, formate dehydrogenase-specific  39.72 
 
 
223 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1451  putative cytoplasmic chaperone TorD  42.29 
 
 
203 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.27 
 
 
207 aa  132  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  44.81 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  44.81 
 
 
211 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0399  cytoplasmic chaperone TorD  39.67 
 
 
208 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.372302  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3124  cytoplasmic chaperone TorD  42.94 
 
 
260 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  44.26 
 
 
211 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3201  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.24 
 
 
200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.634799  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5493  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.11 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.3 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0502  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.8 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2447  cytoplasmic chaperone TorD  40.74 
 
 
222 aa  109  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206479  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2793  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.87 
 
 
212 aa  95.9  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.588272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3466  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.87 
 
 
212 aa  95.9  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.74555  normal  0.35285 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2763  cytoplasmic chaperone TorD  37.57 
 
 
217 aa  95.5  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3263  cytoplasmic chaperone TorD  37.7 
 
 
207 aa  94  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.852314  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1167  hypothetical protein  35.2 
 
 
208 aa  92.8  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2375  hypothetical protein  33.64 
 
 
223 aa  92.4  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00953085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4064  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.5 
 
 
205 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1399  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.71 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0680  cytoplasmic chaperone TorD  33.99 
 
 
210 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.64 
 
 
223 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451099  normal  0.0871667 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0935  cytoplasmic chaperone TorD  36.27 
 
 
205 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2588  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.18 
 
 
223 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.138506 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3711  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.74 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680187  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3733  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.24 
 
 
214 aa  72  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0833  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.47 
 
 
204 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.99 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  24.39 
 
 
209 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  24.39 
 
 
204 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  24.39 
 
 
209 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  24.3 
 
 
209 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1609  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.57 
 
 
222 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1798  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30 
 
 
204 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2352  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.19 
 
 
204 aa  47  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01560  twin-argninine leader-binding protein for DmsA and TorA  30 
 
 
204 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01550  hypothetical protein  30 
 
 
204 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2052  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30 
 
 
204 aa  47  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2300  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30 
 
 
204 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0130846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2039  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30 
 
 
204 aa  47  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1664  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30 
 
 
204 aa  47  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1777  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30 
 
 
204 aa  46.2  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2719  TorD family cytoplasmic chaperone  29.2 
 
 
224 aa  46.6  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.17 
 
 
225 aa  46.2  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1453  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.2 
 
 
198 aa  46.2  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  29.91 
 
 
936 aa  45.4  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1341  TorD family cytoplasmic chaperone  29.2 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.57 
 
 
225 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3258  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.92 
 
 
226 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  31.71 
 
 
205 aa  42  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0704301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>