75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0833 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0833  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 
204 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0935  cytoplasmic chaperone TorD  81.77 
 
 
205 aa  343  8.999999999999999e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3263  cytoplasmic chaperone TorD  66.33 
 
 
207 aa  274  7e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.852314  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3466  cytoplasmic chaperone TorD family protein  64.71 
 
 
212 aa  265  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.74555  normal  0.35285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2793  cytoplasmic chaperone TorD family protein  64.71 
 
 
212 aa  265  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.588272  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4064  cytoplasmic chaperone TorD family protein  66.33 
 
 
205 aa  262  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3733  cytoplasmic chaperone TorD family protein  59.79 
 
 
214 aa  227  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1167  hypothetical protein  55.96 
 
 
208 aa  219  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0680  cytoplasmic chaperone TorD  49.74 
 
 
210 aa  190  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2763  cytoplasmic chaperone TorD  48.29 
 
 
217 aa  189  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2375  hypothetical protein  50.95 
 
 
223 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00953085 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  48.1 
 
 
223 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451099  normal  0.0871667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2588  cytoplasmic chaperone TorD family protein  48.1 
 
 
223 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.138506 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1399  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.05 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1451  putative cytoplasmic chaperone TorD  41.54 
 
 
203 aa  141  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1122  putative chaperone, formate dehydrogenase-specific  40.8 
 
 
223 aa  128  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3711  cytoplasmic chaperone TorD family protein  46.12 
 
 
215 aa  125  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680187  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.18 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.18 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.09 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02275  hypothetical protein  34.92 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.31 
 
 
221 aa  119  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.86 
 
 
225 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3914  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.38 
 
 
225 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3201  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.71 
 
 
200 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.634799  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4423  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3789  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.38 
 
 
225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3718  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.38 
 
 
225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3615  TorA specific chaperone, putative  38.58 
 
 
221 aa  115  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0057  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37 
 
 
221 aa  116  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.82 
 
 
225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.82 
 
 
225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.82 
 
 
225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4134  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.31 
 
 
225 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0399  cytoplasmic chaperone TorD  34.95 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.372302  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.12 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4507  TorA specific chaperone, putative  37.82 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4815  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.5 
 
 
230 aa  112  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0502  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.81 
 
 
220 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5493  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.82 
 
 
235 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003496  putative formate dehydrogenase-specific chaperone  33.51 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4139  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.5 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3124  cytoplasmic chaperone TorD  38.22 
 
 
260 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2447  cytoplasmic chaperone TorD  37.62 
 
 
222 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206479  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36 
 
 
219 aa  99  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.04 
 
 
201 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1913  cytoplasmic chaperone TorD  32.47 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.23 
 
 
219 aa  52.8  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1431  hypothetical protein  26.55 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.19 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.48 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  25.53 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0356  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.88 
 
 
288 aa  49.3  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0115942  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0803  hypothetical protein  26.5 
 
 
247 aa  48.5  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  30.68 
 
 
231 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.55 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  25.37 
 
 
220 aa  45.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  24.35 
 
 
215 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30.68 
 
 
244 aa  45.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 
213 aa  45.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0356  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.03 
 
 
206 aa  45.8  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0328008  hitchhiker  0.00751458 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.54 
 
 
241 aa  45.1  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.97 
 
 
221 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.24 
 
 
237 aa  44.7  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  26.29 
 
 
236 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.97 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.29 
 
 
226 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.26 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1866  hypothetical protein  25 
 
 
233 aa  43.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3682  cytoplasmic chaperone TorD family protein  21.82 
 
 
219 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.966559  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1686  hypothetical protein  24.29 
 
 
233 aa  43.1  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.582738  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.59 
 
 
229 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.71 
 
 
219 aa  42.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1506  hypothetical protein  24.29 
 
 
233 aa  42.4  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  28.36 
 
 
936 aa  41.6  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>