68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3733 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3733  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 		 214 aa  426  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1167  hypothetical protein  60.68 
 
 		 208 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2793  cytoplasmic chaperone TorD family protein  59.79 
 
 		 212 aa  234  7e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.588272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3466  cytoplasmic chaperone TorD family protein  59.79 
 
 		 212 aa  234  7e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.74555  normal  0.35285 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0935  cytoplasmic chaperone TorD  59.07 
 
 		 205 aa  231  8.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4064  cytoplasmic chaperone TorD family protein  58.03 
 
 		 205 aa  230  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3263  cytoplasmic chaperone TorD  54.92 
 
 		 207 aa  215  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.852314  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0833  cytoplasmic chaperone TorD family protein  59.79 
 
 		 204 aa  214  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2763  cytoplasmic chaperone TorD  48.31 
 
 		 217 aa  191  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0680  cytoplasmic chaperone TorD  47.47 
 
 		 210 aa  188  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.54 
 
 		 223 aa  174  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451099  normal  0.0871667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2588  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.09 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.138506 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2375  hypothetical protein  45.74 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953085 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1399  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.31 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1451  putative cytoplasmic chaperone TorD  37.04 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3711  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.12 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680187  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.27 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.74 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0502  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.34 
 
 		 220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4423  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.31 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.34 
 
 		 221 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0399  cytoplasmic chaperone TorD  35.27 
 
 		 208 aa  108  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.372302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5493  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.23 
 
 		 235 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4815  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.31 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.02 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.99 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3914  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.5 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0057  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.38 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3789  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.5 
 
 		 225 aa  104  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3718  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.5 
 
 		 225 aa  104  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.5 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.5 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.5 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4134  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34 
 
 		 225 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3201  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.07 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.634799  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4507  TorA specific chaperone, putative  34 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3615  TorA specific chaperone, putative  34.31 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.87 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4139  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.54 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1122  putative chaperone, formate dehydrogenase-specific  34.41 
 
 		 223 aa  96.7  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02275  hypothetical protein  29.95 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3124  cytoplasmic chaperone TorD  34.38 
 
 		 260 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2447  cytoplasmic chaperone TorD  36.18 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206479  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003496  putative formate dehydrogenase-specific chaperone  27.27 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1913  cytoplasmic chaperone TorD  32.24 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.17 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.63 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  26.47 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.87 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.92 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3047  DMSO-membrane protein  25.53 
 
 		 226 aa  45.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.02 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1686  hypothetical protein  22.3 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.582738  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1866  hypothetical protein  23.02 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  28 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3774  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.53 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.416622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1506  hypothetical protein  22.3 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.22 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  21.67 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  19.9 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0803  hypothetical protein  24.51 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1431  hypothetical protein  23.74 
 
 		 221 aa  42.4  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.44 
 
 		 219 aa  42  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  26.81 
 
 		 220 aa  42  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.09 
 
 		 213 aa  41.6  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>