89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4064 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4064  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 		 205 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0935  cytoplasmic chaperone TorD  68.14 
 
 		 205 aa  273  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3263  cytoplasmic chaperone TorD  66.5 
 
 		 207 aa  270  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.852314  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3466  cytoplasmic chaperone TorD family protein  66 
 
 		 212 aa  266  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.74555  normal  0.35285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2793  cytoplasmic chaperone TorD family protein  66 
 
 		 212 aa  266  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.588272  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0833  cytoplasmic chaperone TorD family protein  66.33 
 
 		 204 aa  239  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1167  hypothetical protein  58.33 
 
 		 208 aa  224  8e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3733  cytoplasmic chaperone TorD family protein  58.03 
 
 		 214 aa  221  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2763  cytoplasmic chaperone TorD  54.97 
 
 		 217 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0680  cytoplasmic chaperone TorD  51.31 
 
 		 210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2588  cytoplasmic chaperone TorD family protein  49.28 
 
 		 223 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.138506 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2375  hypothetical protein  51.72 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953085 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  49.28 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451099  normal  0.0871667 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1399  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.05 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1451  putative cytoplasmic chaperone TorD  39.68 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0399  cytoplasmic chaperone TorD  38.32 
 
 		 208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.372302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3711  cytoplasmic chaperone TorD family protein  47.5 
 
 		 215 aa  124  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680187  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.68 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4134  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.21 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.21 
 
 		 225 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.21 
 
 		 225 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.21 
 
 		 225 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3914  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.21 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3789  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.21 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3718  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.21 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.68 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4423  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.83 
 
 		 231 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4507  TorA specific chaperone, putative  39.15 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0502  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.27 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4815  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.3 
 
 		 230 aa  115  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0057  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.83 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.54 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.54 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1122  putative chaperone, formate dehydrogenase-specific  37.63 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3615  TorA specific chaperone, putative  39.68 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4139  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.1 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.7 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02275  hypothetical protein  33.16 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.3 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3201  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.5 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.634799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.62 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003496  putative formate dehydrogenase-specific chaperone  32.46 
 
 		 208 aa  101  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5493  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.53 
 
 		 235 aa  101  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3124  cytoplasmic chaperone TorD  35.83 
 
 		 260 aa  97.8  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2447  cytoplasmic chaperone TorD  38.93 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1913  cytoplasmic chaperone TorD  37.5 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.01 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.82 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.82 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  27.54 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.35 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  24.15 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.71 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.51 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.63 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2279  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.75 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  27.56 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  26.77 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  26.77 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  26.77 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.5 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  26.98 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  26.32 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  27.19 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  24.65 
 
 		 252 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.79 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.35 
 
 		 244 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0803  hypothetical protein  25.63 
 
 		 247 aa  46.6  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  28 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.88 
 
 		 241 aa  45.1  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  26.47 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  26.71 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  26.47 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1284  cytoplasmic chaperone TorD  27.1 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  26.47 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0356  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.58 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0328008  hitchhiker  0.00751458 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.53 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2445  TorD family cytoplasmic chaperone  33.33 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2164  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.33 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.063946  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2052  TorD family cytoplasmic chaperone  33.33 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0816  hypothetical protein  23.53 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.192641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4654  oxidoreductase component  27.32 
 
 		 197 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  21.68 
 
 		 233 aa  41.6  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  23.5 
 
 		 215 aa  41.6  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0212  hypothetical protein  22.73 
 
 		 185 aa  41.6  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.107215  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  25.98 
 
 		 209 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.84 
 
 		 231 aa  41.2  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30 
 
 		 250 aa  41.2  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.26 
 
 		 219 aa  41.2  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>