92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4139 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4139  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 		 224 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0057  cytoplasmic chaperone TorD family protein  87.5 
 
 		 221 aa  400  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4815  cytoplasmic chaperone TorD family protein  84.78 
 
 		 230 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  84.16 
 
 		 225 aa  384  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4423  cytoplasmic chaperone TorD family protein  82.68 
 
 		 231 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  83.41 
 
 		 225 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  83.41 
 
 		 225 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3789  cytoplasmic chaperone TorD family protein  82.88 
 
 		 225 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3718  cytoplasmic chaperone TorD family protein  82.88 
 
 		 225 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  83.41 
 
 		 225 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4507  TorA specific chaperone, putative  82.43 
 
 		 225 aa  380  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3914  cytoplasmic chaperone TorD family protein  81.98 
 
 		 225 aa  378  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4134  cytoplasmic chaperone TorD family protein  82.51 
 
 		 225 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3615  TorA specific chaperone, putative  78.28 
 
 		 221 aa  362  4e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  79.23 
 
 		 221 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02275  hypothetical protein  49.44 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1451  putative cytoplasmic chaperone TorD  46.77 
 
 		 203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003496  putative formate dehydrogenase-specific chaperone  45.41 
 
 		 208 aa  178  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1913  cytoplasmic chaperone TorD  47.89 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1122  putative chaperone, formate dehydrogenase-specific  43.52 
 
 		 223 aa  164  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.85 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.85 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2375  hypothetical protein  41.9 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2588  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.21 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.138506 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0502  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.41 
 
 		 220 aa  135  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0680  cytoplasmic chaperone TorD  42.33 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.21 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451099  normal  0.0871667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2763  cytoplasmic chaperone TorD  40.53 
 
 		 217 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0399  cytoplasmic chaperone TorD  38.22 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.372302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3124  cytoplasmic chaperone TorD  41.76 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.64 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3201  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.21 
 
 		 200 aa  125  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.634799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.35 
 
 		 211 aa  125  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5493  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3466  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.77 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.74555  normal  0.35285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.79 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2793  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.77 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.588272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.8 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2447  cytoplasmic chaperone TorD  38.38 
 
 		 222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0935  cytoplasmic chaperone TorD  36.14 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4064  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.1 
 
 		 205 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3263  cytoplasmic chaperone TorD  35.98 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.852314  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1167  hypothetical protein  37.63 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1399  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.17 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3733  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.54 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3711  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.75 
 
 		 215 aa  92.8  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680187  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0833  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.5 
 
 		 204 aa  92.4  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  25.48 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  25.48 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  24.88 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  25.4 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  25.4 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  25.4 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  25.4 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  24.29 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1834  chaperone protein TorD  22.94 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  26.05 
 
 		 936 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  21.54 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.63 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  26.16 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  23.08 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.38 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1674  chaperone protein TorD  21.93 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00649542  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  26.56 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.9 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.57 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4049  chaperone protein TorD  26.24 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.81 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  24.41 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  22.96 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4032  chaperone protein TorD  27.07 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.38 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.6 
 
 		 205 aa  45.8  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.62 
 
 		 219 aa  45.1  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.65 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.38 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4211  chaperone protein TorD  26.32 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4104  chaperone protein TorD  26.32 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4153  chaperone protein TorD  26.32 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.39248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.5 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.33 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1192  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.74 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.563307  normal  0.32454 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  21.46 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.17 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1115  chaperone protein TorD  23.7 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  20.95 
 
 		 231 aa  42  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.37 
 
 		 211 aa  42  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.74 
 
 		 225 aa  42  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22270  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.56 
 
 		 228 aa  42  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.44 
 
 		 211 aa  41.6  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  21.84 
 
 		 219 aa  41.6  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1054  chaperone protein TorD  23.44 
 
 		 209 aa  41.6  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>