102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4104 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 
225 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 
225 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 
225 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4134  cytoplasmic chaperone TorD family protein  98.67 
 
 
225 aa  453  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  93.33 
 
 
225 aa  430  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3718  cytoplasmic chaperone TorD family protein  92.44 
 
 
225 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3789  cytoplasmic chaperone TorD family protein  92 
 
 
225 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3914  cytoplasmic chaperone TorD family protein  92.44 
 
 
225 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4507  TorA specific chaperone, putative  91.11 
 
 
225 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4139  cytoplasmic chaperone TorD family protein  83.41 
 
 
224 aa  381  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4815  cytoplasmic chaperone TorD family protein  80.79 
 
 
230 aa  380  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4423  cytoplasmic chaperone TorD family protein  80 
 
 
231 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0057  cytoplasmic chaperone TorD family protein  81.36 
 
 
221 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3615  TorA specific chaperone, putative  78.7 
 
 
221 aa  359  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  80.19 
 
 
221 aa  352  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02275  hypothetical protein  49.73 
 
 
210 aa  188  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003496  putative formate dehydrogenase-specific chaperone  51.67 
 
 
208 aa  181  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1451  putative cytoplasmic chaperone TorD  47.26 
 
 
203 aa  181  9.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1122  putative chaperone, formate dehydrogenase-specific  46.73 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1913  cytoplasmic chaperone TorD  48.35 
 
 
235 aa  168  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.45 
 
 
211 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.45 
 
 
211 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2375  hypothetical protein  43.14 
 
 
223 aa  144  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00953085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2588  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.67 
 
 
223 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.138506 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.67 
 
 
223 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451099  normal  0.0871667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2763  cytoplasmic chaperone TorD  43.39 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3124  cytoplasmic chaperone TorD  44.51 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.99 
 
 
211 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0399  cytoplasmic chaperone TorD  39.3 
 
 
208 aa  138  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.372302  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0502  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.9 
 
 
220 aa  135  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3201  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.63 
 
 
200 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.634799  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0680  cytoplasmic chaperone TorD  41.8 
 
 
210 aa  134  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5493  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.62 
 
 
235 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.87 
 
 
207 aa  132  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.95 
 
 
201 aa  124  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3466  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.56 
 
 
212 aa  123  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.74555  normal  0.35285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2793  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.56 
 
 
212 aa  123  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.588272  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2447  cytoplasmic chaperone TorD  39.46 
 
 
222 aa  122  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206479  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.69 
 
 
219 aa  121  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4064  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.21 
 
 
205 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0935  cytoplasmic chaperone TorD  37.06 
 
 
205 aa  118  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3263  cytoplasmic chaperone TorD  36.55 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.852314  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1167  hypothetical protein  39.15 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3711  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.97 
 
 
215 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680187  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3733  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.5 
 
 
214 aa  98.6  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0833  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.82 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1399  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.17 
 
 
216 aa  92  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  27.69 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  25.24 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  26.77 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  27.18 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  24.76 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  26.67 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  24.52 
 
 
218 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  25.49 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  26.11 
 
 
215 aa  56.2  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  25.46 
 
 
221 aa  55.5  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  22.56 
 
 
223 aa  55.5  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.59 
 
 
219 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  23.5 
 
 
215 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.01 
 
 
229 aa  55.1  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1231  chaperone protein TorD  26.73 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  25.52 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1115  chaperone protein TorD  25.25 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1054  chaperone protein TorD  25.74 
 
 
209 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1674  chaperone protein TorD  22.4 
 
 
193 aa  50.8  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00649542  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1050  chaperone protein TorD  26.34 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  23.44 
 
 
936 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1834  chaperone protein TorD  22.69 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.62 
 
 
219 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  27.13 
 
 
209 aa  48.9  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 
217 aa  48.9  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.79 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.11 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.41 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4032  chaperone protein TorD  30.91 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4049  chaperone protein TorD  30.91 
 
 
210 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2799  chaperone protein TorD  23.81 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.011442 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.66 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.71 
 
 
219 aa  45.8  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.67 
 
 
225 aa  45.8  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.55 
 
 
214 aa  45.8  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3382  cytoplasmic chaperone TorD  30 
 
 
224 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260043  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4104  chaperone protein TorD  30.3 
 
 
210 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4153  chaperone protein TorD  30.3 
 
 
210 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.39248  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  21.62 
 
 
231 aa  45.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 
204 aa  45.4  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0360  Putative anaerobic dehydrogenase-like component  28.28 
 
 
233 aa  45.1  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.49 
 
 
195 aa  45.1  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.31 
 
 
211 aa  45.1  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4211  chaperone protein TorD  30.3 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  19.34 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  23.08 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3682  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.62 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.966559  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0240  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.82 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.76 
 
 
225 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  22.06 
 
 
226 aa  42.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  23.92 
 
 
236 aa  42.7  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.24 
 
 
222 aa  42.4  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.751178 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>