124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3682 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_3682  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 
219 aa  450  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.966559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  57.28 
 
 
219 aa  264  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  55.83 
 
 
219 aa  249  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  50.68 
 
 
219 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  48.86 
 
 
219 aa  229  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2921  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.66 
 
 
218 aa  208  6e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.11 
 
 
241 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.99 
 
 
221 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1431  hypothetical protein  43.44 
 
 
221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.63 
 
 
221 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.18 
 
 
237 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.61 
 
 
221 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  35.33 
 
 
209 aa  122  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0356  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.65 
 
 
206 aa  106  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0328008  hitchhiker  0.00751458 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3864  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.63 
 
 
206 aa  101  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0799961  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1406  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.07 
 
 
206 aa  97.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.13 
 
 
234 aa  85.1  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1309  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.32 
 
 
204 aa  82  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000480203 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.35 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.84 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1798  twin-argninine leader-binding protein DmsD  34.17 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01560  twin-argninine leader-binding protein for DmsA and TorA  34.17 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2052  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.17 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1664  twin-argninine leader-binding protein DmsD  34.17 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2039  twin-argninine leader-binding protein DmsD  34.17 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2300  twin-argninine leader-binding protein DmsD  34.17 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0130846 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01550  hypothetical protein  34.17 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1925  twin-argninine leader-binding protein DmsD  31.39 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  28.98 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.56 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1777  twin-argninine leader-binding protein DmsD  34.17 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  23.04 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1609  twin-argninine leader-binding protein DmsD  33.33 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.55 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  27.27 
 
 
226 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.82 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  21.43 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1606  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.17 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1665  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.17 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1597  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.17 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  0.929764 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1844  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.17 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487956  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.78 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.82 
 
 
195 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1453  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.53 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3391  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.71 
 
 
236 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.34 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1677  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.17 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0685964  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.27 
 
 
229 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3258  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.28 
 
 
226 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  28.45 
 
 
203 aa  59.3  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2719  TorD family cytoplasmic chaperone  29.53 
 
 
224 aa  58.9  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.17 
 
 
212 aa  58.2  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2352  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.01 
 
 
204 aa  58.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  23.2 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  24.24 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1341  TorD family cytoplasmic chaperone  29.53 
 
 
221 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  24.1 
 
 
252 aa  55.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0919  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30 
 
 
236 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507185  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  24.86 
 
 
250 aa  55.5  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00520  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  24.67 
 
 
212 aa  55.1  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.31 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  22.22 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4654  oxidoreductase component  23.9 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1609  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.4 
 
 
284 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.35 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  23.08 
 
 
215 aa  52.8  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1230  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.71 
 
 
196 aa  52.8  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.136646  normal  0.468317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  34.25 
 
 
186 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  34.25 
 
 
186 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  34.25 
 
 
186 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  34.25 
 
 
186 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.51 
 
 
233 aa  52  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.81 
 
 
219 aa  52  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3661  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.65 
 
 
210 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.37 
 
 
221 aa  51.6  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.15 
 
 
211 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  31.58 
 
 
186 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  22.16 
 
 
244 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1122  putative chaperone, formate dehydrogenase-specific  20.56 
 
 
223 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2104  cytoplasmic chaperone  28.93 
 
 
216 aa  49.7  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.88 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.66 
 
 
225 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.683662  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4213  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.56 
 
 
195 aa  48.9  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06850  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  23.79 
 
 
235 aa  48.9  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224601 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18510  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.83 
 
 
230 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2375  hypothetical protein  21.95 
 
 
223 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00953085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.97 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  21.43 
 
 
222 aa  46.2  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2547  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.82 
 
 
199 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0265649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  21.64 
 
 
231 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1674  chaperone protein TorD  24.79 
 
 
193 aa  45.8  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00649542  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0240  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.94 
 
 
204 aa  45.8  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  20.38 
 
 
225 aa  45.8  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.52 
 
 
214 aa  45.4  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0935  cytoplasmic chaperone TorD  23.81 
 
 
205 aa  45.4  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2402  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.81 
 
 
213 aa  45.1  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.54828 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2052  TorD family cytoplasmic chaperone  24.87 
 
 
186 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2445  TorD family cytoplasmic chaperone  24.87 
 
 
186 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2164  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.87 
 
 
186 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.063946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>