120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00520 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_00520  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  100 
 
 
212 aa  434  1e-121  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.06 
 
 
217 aa  186  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  44.55 
 
 
219 aa  182  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  39.23 
 
 
211 aa  158  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06850  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  37.93 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224601 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  36 
 
 
205 aa  132  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.22 
 
 
204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0919  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.8 
 
 
236 aa  122  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507185  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3391  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.36 
 
 
236 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2352  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.14 
 
 
204 aa  118  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3258  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.86 
 
 
226 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1925  twin-argninine leader-binding protein DmsD  33.49 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1609  twin-argninine leader-binding protein DmsD  32.16 
 
 
204 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1777  twin-argninine leader-binding protein DmsD  31.66 
 
 
204 aa  98.2  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01560  twin-argninine leader-binding protein for DmsA and TorA  31.66 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2052  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.66 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01550  hypothetical protein  31.66 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1664  twin-argninine leader-binding protein DmsD  31.66 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2039  twin-argninine leader-binding protein DmsD  31.66 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2300  twin-argninine leader-binding protein DmsD  31.66 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0130846 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1798  twin-argninine leader-binding protein DmsD  31.16 
 
 
204 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1606  twin-argninine leader-binding protein DmsD  33.66 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1665  twin-argninine leader-binding protein DmsD  33.66 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1597  twin-argninine leader-binding protein DmsD  33.66 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  0.929764 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1677  twin-argninine leader-binding protein DmsD  33.17 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0685964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1844  twin-argninine leader-binding protein DmsD  33.17 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487956  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.43 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  28.15 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2921  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.61 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.77 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.08 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.55 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1309  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.51 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000480203 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  28.99 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.17 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.59 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0546  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.17 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.21 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.25 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.87 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.71 
 
 
221 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1406  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.65 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4654  oxidoreductase component  29.61 
 
 
197 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.68 
 
 
228 aa  62.4  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2104  cytoplasmic chaperone  33.94 
 
 
216 aa  62.4  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.52 
 
 
195 aa  62.4  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  30.39 
 
 
186 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1431  hypothetical protein  25.34 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  29.41 
 
 
186 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  29.41 
 
 
186 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1609  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.92 
 
 
284 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1230  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.1 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.136646  normal  0.468317 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  26.47 
 
 
186 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  26.47 
 
 
186 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.44 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.62 
 
 
238 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.13 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.92 
 
 
225 aa  58.9  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.683662  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.58 
 
 
229 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  25.87 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3864  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.95 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0799961  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.38 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.43 
 
 
229 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0356  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.72 
 
 
206 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0328008  hitchhiker  0.00751458 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3682  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.67 
 
 
219 aa  55.1  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.966559  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  23.73 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  25.81 
 
 
215 aa  53.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1341  TorD family cytoplasmic chaperone  30.28 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2719  TorD family cytoplasmic chaperone  30.28 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.39 
 
 
233 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2317  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, Rieske 2Fe-2S subunit  32.89 
 
 
214 aa  52.8  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1453  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.43 
 
 
198 aa  52.8  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25 
 
 
219 aa  52.4  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1590  hypothetical protein  22.71 
 
 
229 aa  52  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531622 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2610  cytoplasmic chaperone TorD family protein  21.76 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000111004  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.31 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2564  cytoplasmic chaperone TorD family protein  21.76 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.241969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2098  chaperone TorD  21.76 
 
 
184 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2732  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.78 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.58 
 
 
190 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.9 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2471  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.72 
 
 
243 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.31 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1551  cytoplasmic chaperone TorD family protein  20.73 
 
 
184 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.143271  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1935  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.66 
 
 
195 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161527  hitchhiker  0.00430197 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01032  hypothetical protein  21.21 
 
 
184 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.77975  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01039  hypothetical protein  21.21 
 
 
184 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1153  chaperone TorD  21.21 
 
 
184 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120482  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1154  chaperone TorD  21.21 
 
 
184 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2294  chaperone, TorD family  21.21 
 
 
184 aa  48.9  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.250336  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1413  chaperone, TorD family  21.21 
 
 
184 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0753019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.92 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1233  TorD family chaperone  23.16 
 
 
184 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1248  chaperone, TorD family  23.16 
 
 
184 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2053  chaperone, TorD family  23.16 
 
 
184 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.110263  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2236  chaperone, TorD family  23.16 
 
 
184 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.68342 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  23.7 
 
 
250 aa  46.6  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1203  chaperone, TorD family  22.63 
 
 
184 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1573  hypothetical protein  16.67 
 
 
185 aa  45.4  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  24.17 
 
 
209 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>