110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06160 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  100 
 
 		 250 aa  513  1e-144  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  53.7 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  49.77 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  50.46 
 
 		 239 aa  217  2e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  50 
 
 		 231 aa  217  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  43.4 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  44.55 
 
 		 226 aa  181  9.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.25 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.12 
 
 		 222 aa  112  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  34.65 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.58 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.93 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30.77 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1590  hypothetical protein  30.45 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531622 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.41 
 
 		 225 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  27.93 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05620  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.78 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.15 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.86 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.44 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.97 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.14 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.56 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.12 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.59 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.38 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1182  hypothetical protein  26.87 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.85 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2104  cytoplasmic chaperone  26.78 
 
 		 216 aa  62  0.000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  31.45 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.683662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  27.33 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  25.23 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.83 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  30.08 
 
 		 936 aa  58.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1192  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.33 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.563307  normal  0.32454 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2354  anaerobic dehydrogenase-like protein  23.08 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.81 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3091  hypothetical protein  35.85 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.697478  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.86 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3682  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.86 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.966559  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00630  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.52 
 
 		 116 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.4 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.81 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1609  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.71 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0546  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.77 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.79 
 
 		 195 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.22 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.61 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.97 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.6 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  23.61 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  28.38 
 
 		 209 aa  52.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  23.61 
 
 		 215 aa  52.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1451  putative cytoplasmic chaperone TorD  23.12 
 
 		 203 aa  52  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1338  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.88 
 
 		 193 aa  52  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.68 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  30.47 
 
 		 186 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  30.47 
 
 		 186 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  25 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27270  hypothetical protein  28.97 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  30.47 
 
 		 186 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  30.47 
 
 		 186 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  30.47 
 
 		 186 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1406  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.95 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0935  cytoplasmic chaperone TorD  34.78 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0360  Putative anaerobic dehydrogenase-like component  28.27 
 
 		 233 aa  48.5  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1494  hypothetical protein  25.47 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1167  hypothetical protein  26.19 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.59 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.59 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1198  anaerobic dehydrogenase protein-like protein  24.64 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2581  hypothetical protein  28.47 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.173611  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1982  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.89 
 
 		 181 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.334911  hitchhiker  0.00497419 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  21.08 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1068  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.15 
 
 		 178 aa  47.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.685316  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2732  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.67 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2921  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.8 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.59 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00520  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  23.7 
 
 		 212 aa  46.6  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2045  hypothetical protein  26.97 
 
 		 199 aa  45.8  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.362778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3124  cytoplasmic chaperone TorD  24.12 
 
 		 260 aa  45.4  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  23.32 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1651  anaerobic dehydrogenase-like protein  28.17 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4815  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.56 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.46 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1431  hypothetical protein  28.14 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0951  hypothetical protein  28.95 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.180933  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1115  chaperone protein TorD  22.97 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  23.15 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  25.87 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.27 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451099  normal  0.0871667 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18510  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.23 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0657  DMSO-membrane protein  26.6 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.527505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1794  hypothetical protein  24.37 
 
 		 347 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.453303  hitchhiker  0.00946321 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  23.81 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  23.15 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.27 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  23.15 
 
 		 204 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.95 
 
 		 211 aa  43.9  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>