140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0455 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 		 211 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  88.63 
 
 		 211 aa  364  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  88.15 
 
 		 211 aa  361  4e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3201  cytoplasmic chaperone TorD family protein  70.74 
 
 		 200 aa  239  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.634799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  65.43 
 
 		 201 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  62.18 
 
 		 219 aa  214  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2447  cytoplasmic chaperone TorD  60.85 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206479  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5493  cytoplasmic chaperone TorD family protein  56.99 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3124  cytoplasmic chaperone TorD  58.47 
 
 		 260 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0502  cytoplasmic chaperone TorD family protein  56.25 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0399  cytoplasmic chaperone TorD  52.63 
 
 		 208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.372302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2763  cytoplasmic chaperone TorD  45.69 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.99 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.99 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.99 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4134  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.45 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.99 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02275  hypothetical protein  41.62 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0680  cytoplasmic chaperone TorD  45.69 
 
 		 210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4423  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.13 
 
 		 231 aa  141  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  44.92 
 
 		 221 aa  141  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4507  TorA specific chaperone, putative  44.39 
 
 		 225 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3914  cytoplasmic chaperone TorD family protein  44.92 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3718  cytoplasmic chaperone TorD family protein  44.39 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3789  cytoplasmic chaperone TorD family protein  44.39 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0057  cytoplasmic chaperone TorD family protein  44.16 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.3 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4139  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.35 
 
 		 224 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003496  putative formate dehydrogenase-specific chaperone  41.62 
 
 		 208 aa  134  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0935  cytoplasmic chaperone TorD  43.94 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3615  TorA specific chaperone, putative  43.85 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4815  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.62 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1122  putative chaperone, formate dehydrogenase-specific  42.16 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1451  putative cytoplasmic chaperone TorD  38.66 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1913  cytoplasmic chaperone TorD  44.26 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3466  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.78 
 
 		 212 aa  117  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.74555  normal  0.35285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2793  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.78 
 
 		 212 aa  117  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.588272  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4064  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.7 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1167  hypothetical protein  41.12 
 
 		 208 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3263  cytoplasmic chaperone TorD  41.49 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.852314  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2375  hypothetical protein  40.82 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953085 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3733  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.31 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0833  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.09 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3711  cytoplasmic chaperone TorD family protein  48.12 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680187  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2588  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.24 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.138506 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1399  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.82 
 
 		 216 aa  98.6  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.73 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451099  normal  0.0871667 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  33.86 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  32.09 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.82 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  25.5 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  25.37 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2799  chaperone protein TorD  26.34 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.011442 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  24.5 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  24.66 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  24.27 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  28.23 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.51 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  29.03 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  25.63 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  28.23 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1198  anaerobic dehydrogenase protein-like protein  29.5 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  28.23 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  26.37 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  32.26 
 
 		 936 aa  52.4  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0356  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.09 
 
 		 288 aa  52  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0115942  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.98 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1230  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.72 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.136646  normal  0.468317 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  28.46 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3682  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.15 
 
 		 219 aa  51.6  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.966559  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.19 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.77 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.53 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.27 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1231  chaperone protein TorD  26.11 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.79 
 
 		 229 aa  48.9  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1050  chaperone protein TorD  25.12 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1054  chaperone protein TorD  25.12 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1777  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.61 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01560  twin-argninine leader-binding protein for DmsA and TorA  29.61 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2052  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.61 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2354  anaerobic dehydrogenase-like protein  29.49 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1664  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.61 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2039  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.61 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01550  hypothetical protein  29.61 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  26.36 
 
 		 186 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2300  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.61 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0130846 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.47 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1115  chaperone protein TorD  24.63 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.36 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.34 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1866  hypothetical protein  26.9 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.59 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1798  twin-argninine leader-binding protein DmsD  28.98 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.03 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.51 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.63 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1686  hypothetical protein  26.21 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.582738  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.12 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.683662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22270  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.29 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.345378 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>