73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3466 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3466  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 
212 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.74555  normal  0.35285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2793  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 
212 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.588272  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3263  cytoplasmic chaperone TorD  71.57 
 
 
207 aa  291  5e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.852314  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0935  cytoplasmic chaperone TorD  66.01 
 
 
205 aa  274  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4064  cytoplasmic chaperone TorD family protein  66 
 
 
205 aa  266  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0833  cytoplasmic chaperone TorD family protein  64.71 
 
 
204 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3733  cytoplasmic chaperone TorD family protein  59.79 
 
 
214 aa  225  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1167  hypothetical protein  56.5 
 
 
208 aa  222  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2763  cytoplasmic chaperone TorD  50 
 
 
217 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2375  hypothetical protein  47.98 
 
 
223 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00953085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0680  cytoplasmic chaperone TorD  48.17 
 
 
210 aa  185  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  47.64 
 
 
223 aa  175  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451099  normal  0.0871667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2588  cytoplasmic chaperone TorD family protein  47.17 
 
 
223 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.138506 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1399  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43 
 
 
216 aa  171  7.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1451  putative cytoplasmic chaperone TorD  41.75 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3711  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.79 
 
 
215 aa  126  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680187  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.34 
 
 
225 aa  125  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.3 
 
 
221 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.56 
 
 
225 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4134  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.56 
 
 
225 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.56 
 
 
225 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.56 
 
 
225 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3914  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.31 
 
 
225 aa  122  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0399  cytoplasmic chaperone TorD  37.62 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.372302  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3789  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.79 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3718  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.79 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4815  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.04 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4139  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.77 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4423  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.04 
 
 
231 aa  119  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1122  putative chaperone, formate dehydrogenase-specific  37.57 
 
 
223 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4507  TorA specific chaperone, putative  37.31 
 
 
225 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0057  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.57 
 
 
221 aa  118  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5493  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.19 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0502  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.34 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.18 
 
 
211 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02275  hypothetical protein  34.55 
 
 
210 aa  116  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.18 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.32 
 
 
207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3615  TorA specific chaperone, putative  36.7 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003496  putative formate dehydrogenase-specific chaperone  34.55 
 
 
208 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.18 
 
 
211 aa  108  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3201  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.18 
 
 
200 aa  106  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.634799  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3124  cytoplasmic chaperone TorD  37.7 
 
 
260 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2447  cytoplasmic chaperone TorD  41.98 
 
 
222 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.1 
 
 
201 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1913  cytoplasmic chaperone TorD  36.87 
 
 
235 aa  95.9  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.28 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  28.63 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.29 
 
 
195 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  26 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  25.5 
 
 
209 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  25.5 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2354  anaerobic dehydrogenase-like protein  24.62 
 
 
210 aa  45.1  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  25.5 
 
 
209 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27.87 
 
 
205 aa  45.1  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.63 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  25.68 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.91 
 
 
219 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  24.82 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  25.53 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.81 
 
 
219 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  22.82 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1309  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.16 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000480203 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  25.82 
 
 
231 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  27.87 
 
 
936 aa  42.7  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2799  chaperone protein TorD  26.7 
 
 
211 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.011442 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.42 
 
 
225 aa  42  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4654  oxidoreductase component  26.67 
 
 
197 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.74 
 
 
212 aa  41.6  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.5 
 
 
213 aa  41.6  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18510  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30.83 
 
 
230 aa  41.6  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.32 
 
 
226 aa  41.6  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1431  hypothetical protein  24.63 
 
 
221 aa  41.6  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>