128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3214 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  100 
 
 
209 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  98.09 
 
 
209 aa  420  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  99.51 
 
 
204 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  96.65 
 
 
209 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1054  chaperone protein TorD  76.92 
 
 
209 aa  331  5e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1050  chaperone protein TorD  76.44 
 
 
209 aa  327  6e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1115  chaperone protein TorD  75.96 
 
 
209 aa  327  6e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1231  chaperone protein TorD  73.56 
 
 
217 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  58.91 
 
 
221 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  60.61 
 
 
223 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  59.41 
 
 
215 aa  241  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  55.56 
 
 
218 aa  229  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2799  chaperone protein TorD  49 
 
 
211 aa  189  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.011442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1834  chaperone protein TorD  45.28 
 
 
236 aa  175  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0986  chaperone protein TorD  36.36 
 
 
235 aa  134  8e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  38.73 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  35.58 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  34.8 
 
 
215 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  33.5 
 
 
215 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1234  chaperone protein TorD  32.99 
 
 
199 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.713682  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2644  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.99 
 
 
199 aa  99  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.437385  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1116  chaperone protein TorD  32.49 
 
 
199 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01001  chaperone protein TorD  32.49 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01008  hypothetical protein  32.49 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1109  chaperone protein TorD  32.49 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2597  chaperone protein TorD  32.49 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.382681 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2126  chaperone protein TorD  32.99 
 
 
199 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2732  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.67 
 
 
237 aa  95.9  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.1 
 
 
221 aa  95.1  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2316  chaperone protein TorD  32.49 
 
 
199 aa  94  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4211  chaperone protein TorD  34.87 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4104  chaperone protein TorD  34.36 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4153  chaperone protein TorD  34.36 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.39248  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4032  chaperone protein TorD  34.36 
 
 
210 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4049  chaperone protein TorD  34.9 
 
 
210 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  30.77 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.77 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.77 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.77 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4507  TorA specific chaperone, putative  28.21 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.18 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4134  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.78 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3718  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.18 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3789  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.18 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4217  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.74 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.154602  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3914  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.67 
 
 
225 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.64 
 
 
221 aa  63.2  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1674  chaperone protein TorD  25.93 
 
 
193 aa  62  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00649542  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4423  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.25 
 
 
231 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0057  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.93 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.48 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4815  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.75 
 
 
230 aa  59.3  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1122  putative chaperone, formate dehydrogenase-specific  28.06 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.17 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.95 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  24.16 
 
 
231 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3615  TorA specific chaperone, putative  24.62 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.35 
 
 
211 aa  56.6  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4139  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.4 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.97 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.23 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.42 
 
 
211 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.42 
 
 
211 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.82 
 
 
207 aa  55.1  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.63 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  25 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.53 
 
 
211 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.55 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1284  cytoplasmic chaperone TorD  30.28 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1876  cytoplasmic chaperone TorD  30.95 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.41 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.6 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3382  cytoplasmic chaperone TorD  23.23 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260043  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.4 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1198  anaerobic dehydrogenase protein-like protein  22.79 
 
 
223 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5493  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.38 
 
 
235 aa  52  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.78 
 
 
229 aa  51.6  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1750  cytoplasmic chaperone TorD  25.51 
 
 
208 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.47 
 
 
239 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.09 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  23.86 
 
 
209 aa  50.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.01 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  25 
 
 
231 aa  48.9  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.23 
 
 
228 aa  48.9  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1913  cytoplasmic chaperone TorD  24.3 
 
 
235 aa  48.5  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.55 
 
 
219 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2402  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.42 
 
 
213 aa  48.1  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.54828 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.71 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  25.19 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  25.19 
 
 
186 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.27 
 
 
225 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2793  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.5 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.588272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3466  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.5 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.74555  normal  0.35285 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0240  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26 
 
 
204 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18510  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.33 
 
 
230 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  23.26 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3201  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.34 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.634799  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  25.19 
 
 
186 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  21.57 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.683662  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2921  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.31 
 
 
218 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>