89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1284 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1284  cytoplasmic chaperone TorD  100 
 
 		 203 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1750  cytoplasmic chaperone TorD  41.54 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3382  cytoplasmic chaperone TorD  37.97 
 
 		 224 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3047  DMSO-membrane protein  35.96 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3774  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.95 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.416622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1876  cytoplasmic chaperone TorD  35.71 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  25.24 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0657  DMSO-membrane protein  34.67 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.527505 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  31.69 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  31.69 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.99 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  23.67 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  30.99 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  30.99 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1651  anaerobic dehydrogenase-like protein  28.08 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.7 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1234  chaperone protein TorD  32.43 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.713682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0951  hypothetical protein  26.37 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.180933  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.32 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1198  anaerobic dehydrogenase protein-like protein  28.65 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  33.85 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1050  chaperone protein TorD  31.17 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1054  chaperone protein TorD  31.17 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1115  chaperone protein TorD  31.94 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1231  chaperone protein TorD  31.61 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.81 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2316  chaperone protein TorD  30.97 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  28.07 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.76 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2104  cytoplasmic chaperone  25.15 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.24 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2644  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.97 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.437385  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01001  chaperone protein TorD  30.97 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2597  chaperone protein TorD  30.97 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.382681 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01008  hypothetical protein  30.97 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1116  chaperone protein TorD  31.53 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1109  chaperone protein TorD  30.97 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0360  Putative anaerobic dehydrogenase-like component  30.19 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1230  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.47 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.136646  normal  0.468317 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  27.68 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.81 
 
 		 229 aa  52  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.78 
 
 		 238 aa  51.6  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0546  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.81 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.59 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1834  chaperone protein TorD  29 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2126  chaperone protein TorD  30.09 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  26.45 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  22.41 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  26.45 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  29.46 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2045  hypothetical protein  25.14 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.362778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  28.57 
 
 		 221 aa  48.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  26.45 
 
 		 186 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4032  chaperone protein TorD  29.63 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1609  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.96 
 
 		 284 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1925  twin-argninine leader-binding protein DmsD  28.99 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4049  chaperone protein TorD  30.56 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  26.45 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  28.19 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.25 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4211  chaperone protein TorD  30.56 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.88 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  25.62 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3661  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.85 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4064  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.01 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4153  chaperone protein TorD  29.63 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.39248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4104  chaperone protein TorD  29.63 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  24.21 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0677  hypothetical protein  35.23 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.178124  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1866  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.49 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320246 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3049  hypothetical protein  27.51 
 
 		 224 aa  44.7  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.729916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3201  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.56 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.634799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1144  DMSO-membrane protein  27.8 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  29.3 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22270  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.34 
 
 		 228 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4222  hypothetical protein  23.83 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000173102  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2799  chaperone protein TorD  29.09 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.011442 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.27 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1338  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.92 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4423  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.34 
 
 		 231 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.25 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0368471 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1563  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.11 
 
 		 226 aa  42  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.548826  normal  0.822991 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4217  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.14 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.154602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1122  putative chaperone, formate dehydrogenase-specific  26.26 
 
 		 223 aa  41.6  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2732  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.66 
 
 		 237 aa  41.6  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27590  hypothetical protein  24.58 
 
 		 270 aa  41.6  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.945374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.48 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>