91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3661 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3661  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 		 210 aa  443  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  96.67 
 
 		 210 aa  428  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4213  cytoplasmic chaperone TorD family protein  47.94 
 
 		 195 aa  191  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0240  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.32 
 
 		 204 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2547  cytoplasmic chaperone TorD family protein  46.56 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0265649  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.37 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.86 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  35.94 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.81 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.06 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  29.41 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0546  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.25 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.91 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.66 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.27 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.27 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18510  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30.37 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.58 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.07 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1230  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.62 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.136646  normal  0.468317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.88 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1609  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.11 
 
 		 284 aa  61.6  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  29.29 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.33 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.683662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  31.11 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2104  cytoplasmic chaperone  27.74 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.27 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0951  hypothetical protein  28.78 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.180933  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  24.82 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2317  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, Rieske 2Fe-2S subunit  28 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.97 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.54 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.87 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2471  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.19 
 
 		 243 aa  52  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3682  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.65 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.966559  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.64 
 
 		 219 aa  51.6  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.17 
 
 		 221 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.06 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.21 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.36 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  24.81 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  27.78 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  27.78 
 
 		 186 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1431  hypothetical protein  27.86 
 
 		 221 aa  48.5  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  28.57 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  28.57 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  26.19 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2921  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.22 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  24.06 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.04 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  26.12 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1192  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.15 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.563307  normal  0.32454 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1284  cytoplasmic chaperone TorD  28.3 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  28.37 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1338  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.5 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.78 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.91 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0512  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase-like protein  30.77 
 
 		 313 aa  45.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.44 
 
 		 221 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2052  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.72 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01550  hypothetical protein  26.72 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2300  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.72 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0130846 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01560  twin-argninine leader-binding protein for DmsA and TorA  26.72 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1664  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.72 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2039  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.72 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1925  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27.42 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.38 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1798  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.72 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1309  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000480203 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2045  hypothetical protein  25.31 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.362778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  28.57 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22270  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.56 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1609  twin-argninine leader-binding protein DmsD  25.86 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00520  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  23.39 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2606  hypothetical protein  29.13 
 
 		 280 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.584677 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  27.27 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1651  anaerobic dehydrogenase-like protein  26.83 
 
 		 270 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1777  twin-argninine leader-binding protein DmsD  25.93 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  25.71 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1677  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.03 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0685964  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1606  twin-argninine leader-binding protein DmsD  33.9 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1844  twin-argninine leader-binding protein DmsD  33.9 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1665  twin-argninine leader-binding protein DmsD  33.9 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1597  twin-argninine leader-binding protein DmsD  33.9 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  0.929764 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3258  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.61 
 
 		 226 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2243  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.97 
 
 		 189 aa  42.4  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1982  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.54 
 
 		 181 aa  42  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.334911  hitchhiker  0.00497419 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3391  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.61 
 
 		 236 aa  42  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0919  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.55 
 
 		 236 aa  41.6  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507185  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>