118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0240 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0240  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 
204 aa  420  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2547  cytoplasmic chaperone TorD family protein  79.7 
 
 
199 aa  327  8e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0265649  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4213  cytoplasmic chaperone TorD family protein  70.77 
 
 
195 aa  292  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  46.31 
 
 
210 aa  187  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3661  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.32 
 
 
210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.65 
 
 
231 aa  85.1  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.07 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.8 
 
 
195 aa  82  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  32.14 
 
 
236 aa  81.3  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  35.21 
 
 
226 aa  79  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.85 
 
 
212 aa  79  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0546  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.7 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.07 
 
 
233 aa  71.6  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.29 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.25 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1230  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.08 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.136646  normal  0.468317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  31.09 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  31.09 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  31.09 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  31.09 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.1 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.78 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  30.25 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.89 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2317  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, Rieske 2Fe-2S subunit  39.29 
 
 
214 aa  64.7  0.0000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.2 
 
 
234 aa  61.2  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18510  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.57 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1651  anaerobic dehydrogenase-like protein  28.77 
 
 
270 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.54 
 
 
228 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.06 
 
 
225 aa  60.1  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.683662  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.04 
 
 
211 aa  58.9  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30.57 
 
 
239 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.33 
 
 
225 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.48 
 
 
211 aa  55.5  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  25.58 
 
 
209 aa  54.7  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1494  hypothetical protein  31.34 
 
 
205 aa  54.7  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.86 
 
 
225 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1866  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.84 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0320246 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1609  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.5 
 
 
284 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  27.82 
 
 
215 aa  51.6  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4222  hypothetical protein  27.13 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000173102  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2104  cytoplasmic chaperone  29.57 
 
 
216 aa  49.7  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  29.41 
 
 
203 aa  49.7  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.08 
 
 
222 aa  49.3  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.11 
 
 
241 aa  48.9  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.17 
 
 
219 aa  48.5  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22270  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.67 
 
 
228 aa  48.1  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  24.51 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1309  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.74 
 
 
204 aa  47.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000480203 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1606  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.11 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1665  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.11 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1597  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.11 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  0.929764 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1677  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.11 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0685964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1844  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.11 
 
 
204 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487956  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  25.93 
 
 
236 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  26 
 
 
209 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3258  twin-argninine leader-binding protein DmsD  28.23 
 
 
226 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2921  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.78 
 
 
218 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.71 
 
 
219 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  25.56 
 
 
215 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  26.06 
 
 
204 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2471  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25 
 
 
243 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.09 
 
 
231 aa  46.6  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01560  twin-argninine leader-binding protein for DmsA and TorA  26.5 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2052  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.5 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1192  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.83 
 
 
285 aa  46.2  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.563307  normal  0.32454 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1664  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.5 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.02 
 
 
205 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  25.35 
 
 
209 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0919  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27.87 
 
 
236 aa  46.2  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507185  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3391  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27.87 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2039  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.5 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1609  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.5 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2300  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.5 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0130846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.33 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01550  hypothetical protein  26.5 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0951  hypothetical protein  27.82 
 
 
192 aa  45.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.180933  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3682  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.94 
 
 
219 aa  45.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.966559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1798  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.5 
 
 
204 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.69 
 
 
238 aa  45.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0512  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase-like protein  29.63 
 
 
313 aa  45.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1563  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.61 
 
 
226 aa  45.4  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.548826  normal  0.822991 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.68 
 
 
219 aa  45.1  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.19 
 
 
217 aa  45.1  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2380  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.9 
 
 
232 aa  45.1  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.434719 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.29 
 
 
219 aa  45.1  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.1 
 
 
221 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2243  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.03 
 
 
189 aa  45.1  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2610  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.14 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000111004  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2564  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.14 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.241969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2098  chaperone TorD  32.14 
 
 
184 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  25 
 
 
223 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1233  TorD family chaperone  31.06 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1248  chaperone, TorD family  31.06 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1203  chaperone, TorD family  31.06 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2236  chaperone, TorD family  31.06 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.68342 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.28 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0360  Putative anaerobic dehydrogenase-like component  26.72 
 
 
233 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0930  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.23 
 
 
240 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.542381 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>