53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2380 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2380  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 
232 aa  437  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.434719 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2368  cytoplasmic chaperone TorD family protein  97.64 
 
 
234 aa  294  7e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.447639  normal  0.379865 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22270  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  55.75 
 
 
228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.38 
 
 
207 aa  97.4  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000683605 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4222  hypothetical protein  30.24 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000173102  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17900  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  31.53 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.256689  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3049  hypothetical protein  32.69 
 
 
224 aa  65.1  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.729916  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02390  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.32 
 
 
218 aa  64.3  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.73 
 
 
244 aa  62  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.15 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  29.26 
 
 
226 aa  59.3  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.71 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.21 
 
 
190 aa  56.6  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1651  anaerobic dehydrogenase-like protein  27.19 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0546  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.58 
 
 
219 aa  55.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.62 
 
 
226 aa  55.8  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.15 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.4 
 
 
239 aa  53.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0951  hypothetical protein  29.86 
 
 
192 aa  52  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.180933  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.77 
 
 
205 aa  51.6  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.35 
 
 
214 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  26.63 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.09 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  31.58 
 
 
225 aa  49.3  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.683662  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.4 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.15 
 
 
213 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  26.79 
 
 
236 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4213  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.72 
 
 
195 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.58 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0677  hypothetical protein  34.31 
 
 
222 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.178124  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0240  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.69 
 
 
204 aa  45.8  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1866  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.28 
 
 
203 aa  45.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0320246 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  29.57 
 
 
220 aa  45.8  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 
202 aa  45.4  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0368471 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.17 
 
 
195 aa  45.4  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  23.35 
 
 
250 aa  45.4  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0197  delta-subunit of ethylbenzene dehydrogenase  25.59 
 
 
249 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1167  hypothetical protein  31.48 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2317  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, Rieske 2Fe-2S subunit  27.34 
 
 
214 aa  45.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1563  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.32 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.548826  normal  0.822991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.16 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1338  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.78 
 
 
193 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18510  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.57 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2375  hypothetical protein  34.78 
 
 
223 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00953085 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.15 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1590  hypothetical protein  29.41 
 
 
229 aa  43.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531622 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  22.97 
 
 
231 aa  42.7  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.18 
 
 
207 aa  42.4  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  23.53 
 
 
215 aa  42.4  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  23.7 
 
 
215 aa  42  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2588  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.14 
 
 
223 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.138506 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.69 
 
 
217 aa  41.6  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.14 
 
 
223 aa  41.6  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451099  normal  0.0871667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>