36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17900 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_17900  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  100 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.256689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4222  hypothetical protein  32.2 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000173102  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.39 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22270  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.06 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3049  hypothetical protein  30.24 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.729916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.76 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.87 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  28.57 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2380  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.33 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.434719 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0546  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.14 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2368  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.33 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.447639  normal  0.379865 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2581  hypothetical protein  29.55 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.173611  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  27.8 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.65 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.02 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.52 
 
 		 234 aa  51.6  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1182  hypothetical protein  25 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.35 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  22 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000683605 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1651  anaerobic dehydrogenase-like protein  23.33 
 
 		 270 aa  48.5  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1338  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.49 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1494  hypothetical protein  36.36 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.41 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.6 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.67 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2317  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, Rieske 2Fe-2S subunit  26.06 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0951  hypothetical protein  27.14 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.180933  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18510  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.19 
 
 		 230 aa  45.4  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.76 
 
 		 217 aa  45.4  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.24 
 
 		 231 aa  45.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  20.63 
 
 		 233 aa  45.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1338  DMSO reductase family type II enzyme chaperone  28.23 
 
 		 272 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.783269  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  25.81 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2375  hypothetical protein  28.79 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953085 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2467  DMSO reductase family type II enzyme chaperone  26.48 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0445318  normal  0.64747 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07890  hypothetical protein  28.12 
 
 		 210 aa  42  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>