182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0472 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 
213 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  68.5 
 
 
212 aa  280  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.16 
 
 
195 aa  131  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.13 
 
 
231 aa  98.2  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.74 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.5 
 
 
214 aa  89.7  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  32.72 
 
 
252 aa  85.5  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.01 
 
 
190 aa  84  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0240  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.07 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2547  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.11 
 
 
199 aa  82  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0265649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.66 
 
 
229 aa  82  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.91 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.28 
 
 
233 aa  79  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18510  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  35.29 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  31.69 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.67 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.02 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  29.75 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  28.43 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1182  hypothetical protein  28.8 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.85 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  32.62 
 
 
226 aa  72  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.9 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30.94 
 
 
244 aa  71.6  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2317  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, Rieske 2Fe-2S subunit  30.27 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.94 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.73 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30.56 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2104  cytoplasmic chaperone  28.83 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01560  twin-argninine leader-binding protein for DmsA and TorA  32.81 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2052  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.81 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01550  hypothetical protein  32.81 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1664  twin-argninine leader-binding protein DmsD  32.81 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1798  twin-argninine leader-binding protein DmsD  32.81 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2300  twin-argninine leader-binding protein DmsD  32.81 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0130846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2039  twin-argninine leader-binding protein DmsD  32.81 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1777  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.89 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.42 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.12 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  27.85 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1651  anaerobic dehydrogenase-like protein  34.92 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4213  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 
195 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.43 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1609  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.19 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  26.03 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.82 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.14 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3661  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.07 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3391  twin-argninine leader-binding protein DmsD  32.52 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.19 
 
 
225 aa  63.5  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.683662  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  28.47 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  24.17 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1844  twin-argninine leader-binding protein DmsD  28.14 
 
 
204 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487956  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0919  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.56 
 
 
236 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507185  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1665  twin-argninine leader-binding protein DmsD  28.14 
 
 
204 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1606  twin-argninine leader-binding protein DmsD  28.14 
 
 
204 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3258  twin-argninine leader-binding protein DmsD  32.23 
 
 
226 aa  62.4  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1597  twin-argninine leader-binding protein DmsD  28.14 
 
 
204 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  0.929764 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1677  twin-argninine leader-binding protein DmsD  28 
 
 
204 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0685964  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.91 
 
 
238 aa  62  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0546  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.18 
 
 
219 aa  61.6  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.78 
 
 
231 aa  60.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  24.19 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1925  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1231  chaperone protein TorD  29.14 
 
 
217 aa  58.5  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.01 
 
 
204 aa  58.9  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  23.22 
 
 
215 aa  58.5  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.77 
 
 
241 aa  58.5  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  28.17 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  28.17 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0197  delta-subunit of ethylbenzene dehydrogenase  30.41 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  28.17 
 
 
209 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30.23 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.06 
 
 
237 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.06 
 
 
221 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.73 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  24.06 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  28.17 
 
 
209 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2354  anaerobic dehydrogenase-like protein  32.03 
 
 
210 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2352  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.72 
 
 
204 aa  56.2  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0356  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.82 
 
 
288 aa  55.8  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0115942  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  20.85 
 
 
229 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  28.92 
 
 
203 aa  55.8  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.15 
 
 
219 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.53 
 
 
219 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0951  hypothetical protein  23.62 
 
 
192 aa  55.1  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.180933  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1050  chaperone protein TorD  28.28 
 
 
209 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1230  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.43 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.136646  normal  0.468317 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2402  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26 
 
 
180 aa  53.9  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1054  chaperone protein TorD  27.59 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1115  chaperone protein TorD  24.3 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  26.13 
 
 
186 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  26.13 
 
 
186 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  23.83 
 
 
218 aa  52.8  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.33 
 
 
202 aa  52  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0368471 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.64 
 
 
221 aa  52  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.08 
 
 
221 aa  52  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1309  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.77 
 
 
204 aa  52  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000480203 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  27.73 
 
 
186 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.723309 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>