106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27400 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  100 
 
 
244 aa  501  1e-141  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  72.48 
 
 
231 aa  332  3e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  62.21 
 
 
236 aa  281  5.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  53.7 
 
 
239 aa  236  3e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  49.77 
 
 
250 aa  227  1e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  46.43 
 
 
252 aa  210  2e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  49.77 
 
 
226 aa  209  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  47.91 
 
 
225 aa  204  9e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.27 
 
 
222 aa  135  8e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.04 
 
 
225 aa  118  7.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05620  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  31.02 
 
 
242 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  32.77 
 
 
231 aa  106  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  32.59 
 
 
226 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.6 
 
 
231 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1590  hypothetical protein  32.54 
 
 
229 aa  92.4  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531622 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.7 
 
 
233 aa  85.5  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.46 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.88 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  29.46 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  32.53 
 
 
225 aa  82  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.683662  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.04 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  28.02 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1182  hypothetical protein  29.17 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.94 
 
 
213 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  26.99 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.41 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  31.37 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.98 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1192  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.65 
 
 
285 aa  65.1  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.563307  normal  0.32454 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1982  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  32.45 
 
 
181 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.334911  hitchhiker  0.00497419 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  25.46 
 
 
215 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  26.82 
 
 
218 aa  63.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.83 
 
 
195 aa  63.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1068  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  33.33 
 
 
178 aa  61.6  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.685316  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00630  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30.91 
 
 
116 aa  61.6  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.07 
 
 
238 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.84 
 
 
219 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  26.79 
 
 
936 aa  60.1  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  25.24 
 
 
215 aa  59.7  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2799  chaperone protein TorD  25.7 
 
 
211 aa  59.7  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.011442 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  25.24 
 
 
215 aa  59.3  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.79 
 
 
229 aa  58.9  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.7 
 
 
234 aa  58.5  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.27 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2354  anaerobic dehydrogenase-like protein  23.65 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27270  hypothetical protein  30.47 
 
 
284 aa  56.6  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0546  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.77 
 
 
219 aa  55.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1338  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.29 
 
 
193 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1494  hypothetical protein  29.84 
 
 
205 aa  53.5  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.71 
 
 
241 aa  53.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1115  chaperone protein TorD  26.09 
 
 
209 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18510  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.21 
 
 
230 aa  52.4  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2921  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.35 
 
 
218 aa  52  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1406  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.49 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.63 
 
 
214 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.14 
 
 
219 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1050  chaperone protein TorD  26.67 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3682  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.16 
 
 
219 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.966559  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2104  cytoplasmic chaperone  27.54 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.74 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4213  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.38 
 
 
195 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2317  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, Rieske 2Fe-2S subunit  25.47 
 
 
214 aa  50.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  26.45 
 
 
215 aa  49.7  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2380  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.08 
 
 
232 aa  48.9  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.434719 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1609  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.1 
 
 
284 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3091  hypothetical protein  27.67 
 
 
236 aa  48.5  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.697478  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0935  cytoplasmic chaperone TorD  31.46 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1651  anaerobic dehydrogenase-like protein  27.73 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.37 
 
 
221 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22270  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.38 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2368  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.08 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.447639  normal  0.379865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1431  hypothetical protein  25.87 
 
 
221 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1054  chaperone protein TorD  25.33 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  23.26 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  24.65 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1230  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.77 
 
 
196 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.136646  normal  0.468317 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  23.26 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4064  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.35 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.86 
 
 
221 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1794  hypothetical protein  27.05 
 
 
347 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.453303  hitchhiker  0.00946321 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3864  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.06 
 
 
206 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0799961  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  23.26 
 
 
209 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.67 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  25.29 
 
 
186 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.93 
 
 
201 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3049  hypothetical protein  24.03 
 
 
224 aa  45.4  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.729916  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  24.71 
 
 
186 aa  45.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  24.71 
 
 
186 aa  45.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0951  hypothetical protein  30.66 
 
 
192 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.180933  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.52 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1231  chaperone protein TorD  24.78 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0816  hypothetical protein  23.5 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.192641  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1451  putative cytoplasmic chaperone TorD  22 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2045  hypothetical protein  23.71 
 
 
199 aa  43.5  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.362778  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1876  cytoplasmic chaperone TorD  31.21 
 
 
213 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.44 
 
 
221 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  24.71 
 
 
186 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.9 
 
 
217 aa  43.9  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>