65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27270 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_27270  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  580  1.0000000000000001e-165  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1192  cytoplasmic chaperone TorD family protein  44.5 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.563307  normal  0.32454 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27590  hypothetical protein  30.09 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.945374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.05 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.77 
 
 		 228 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.05 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  28.76 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.47 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.7 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.683662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.39 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  26.44 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.54 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.67 
 
 		 214 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2104  cytoplasmic chaperone  25.4 
 
 		 216 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.69 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2471  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00630  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.46 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.9 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.38 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30.47 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.66 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.78 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.25 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  35.71 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.94 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1230  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.97 
 
 		 196 aa  52.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.136646  normal  0.468317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0546  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.26 
 
 		 219 aa  52.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18510  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.77 
 
 		 230 aa  52.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.25 
 
 		 219 aa  52.8  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.59 
 
 		 222 aa  52.4  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.97 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  26.32 
 
 		 203 aa  50.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  25.97 
 
 		 231 aa  49.3  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2039  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27.08 
 
 		 204 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01560  twin-argninine leader-binding protein for DmsA and TorA  27.08 
 
 		 204 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2052  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.08 
 
 		 204 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1664  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27.08 
 
 		 204 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1798  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27.08 
 
 		 204 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01550  hypothetical protein  27.08 
 
 		 204 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2300  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27.08 
 
 		 204 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0130846 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1609  twin-argninine leader-binding protein DmsD  28.06 
 
 		 204 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  26.02 
 
 		 186 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  24.39 
 
 		 186 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  26.02 
 
 		 186 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1925  twin-argninine leader-binding protein DmsD  31.96 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1777  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.76 
 
 		 204 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3258  twin-argninine leader-binding protein DmsD  32.97 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0919  twin-argninine leader-binding protein DmsD  32.97 
 
 		 236 aa  47.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05620  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  22.12 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3391  twin-argninine leader-binding protein DmsD  32.97 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.17 
 
 		 212 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.33 
 
 		 204 aa  46.6  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2732  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.44 
 
 		 237 aa  46.6  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  25.2 
 
 		 186 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2317  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, Rieske 2Fe-2S subunit  26.56 
 
 		 214 aa  45.4  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.59 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  29.91 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  25.2 
 
 		 186 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.53 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.92 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1844  twin-argninine leader-binding protein DmsD  37.5 
 
 		 204 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1606  twin-argninine leader-binding protein DmsD  37.5 
 
 		 204 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1677  twin-argninine leader-binding protein DmsD  37.5 
 
 		 204 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0685964  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1597  twin-argninine leader-binding protein DmsD  37.5 
 
 		 204 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  0.929764 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1665  twin-argninine leader-binding protein DmsD  37.5 
 
 		 204 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>