44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05620 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_05620  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  100 
 
 		 242 aa  501  1e-141  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1590  hypothetical protein  57.96 
 
 		 229 aa  274  9e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531622 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  35.24 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.26 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  35.21 
 
 		 239 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.27 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.33 
 
 		 225 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  31.02 
 
 		 244 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  27.98 
 
 		 236 aa  98.2  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.4 
 
 		 225 aa  95.5  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.31 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  31.42 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.78 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.89 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  24.55 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.01 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.49 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.4 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.48 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  25.79 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.69 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.54 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.59 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.12 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.6 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1182  hypothetical protein  25.87 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.92 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.86 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  24.51 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2799  chaperone protein TorD  22.91 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.011442 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.65 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  20 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1431  hypothetical protein  28.99 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27270  hypothetical protein  22.12 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1451  putative cytoplasmic chaperone TorD  34.09 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2921  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.11 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.33 
 
 		 241 aa  45.4  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  23.08 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0816  hypothetical protein  18.89 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.192641  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0610  conserved hypothetical protein  22.48 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.64 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  21.57 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  21.24 
 
 		 219 aa  42  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.424165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>