147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2226 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 
221 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.44 
 
 
219 aa  193  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.63 
 
 
219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1431  hypothetical protein  41.89 
 
 
221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.82 
 
 
221 aa  178  7e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.46 
 
 
237 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.46 
 
 
221 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.18 
 
 
219 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40 
 
 
219 aa  176  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.99 
 
 
241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3682  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.61 
 
 
219 aa  159  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.966559  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2921  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.89 
 
 
218 aa  153  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  37.93 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1406  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.36 
 
 
206 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1309  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.8 
 
 
204 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000480203 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0356  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.96 
 
 
206 aa  88.6  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0328008  hitchhiker  0.00751458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.1 
 
 
205 aa  85.1  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3864  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.17 
 
 
206 aa  84.7  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0799961  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.08 
 
 
217 aa  84.7  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  25.23 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.32 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  26.83 
 
 
215 aa  72  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.14 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1925  twin-argninine leader-binding protein DmsD  25.12 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.84 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.12 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00520  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  23.25 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3258  twin-argninine leader-binding protein DmsD  32.76 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  30.4 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3391  twin-argninine leader-binding protein DmsD  33.04 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.09 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.78 
 
 
233 aa  65.1  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2352  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.71 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01560  twin-argninine leader-binding protein for DmsA and TorA  25.53 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2052  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.53 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01550  hypothetical protein  25.53 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1664  twin-argninine leader-binding protein DmsD  25.53 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1798  twin-argninine leader-binding protein DmsD  25.53 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2300  twin-argninine leader-binding protein DmsD  25.53 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0130846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2039  twin-argninine leader-binding protein DmsD  25.53 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4654  oxidoreductase component  30.23 
 
 
197 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1609  twin-argninine leader-binding protein DmsD  25.53 
 
 
204 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.41 
 
 
228 aa  62.4  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  31.78 
 
 
203 aa  62.4  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0919  twin-argninine leader-binding protein DmsD  32.17 
 
 
236 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507185  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18510  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.36 
 
 
230 aa  60.1  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2719  TorD family cytoplasmic chaperone  26.99 
 
 
224 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1453  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.99 
 
 
198 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1777  twin-argninine leader-binding protein DmsD  24.82 
 
 
204 aa  60.1  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.3 
 
 
211 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1341  TorD family cytoplasmic chaperone  30.33 
 
 
221 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.34 
 
 
195 aa  58.9  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  27.01 
 
 
215 aa  58.5  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1606  twin-argninine leader-binding protein DmsD  28.57 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1665  twin-argninine leader-binding protein DmsD  28.57 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1597  twin-argninine leader-binding protein DmsD  28.57 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  0.929764 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1844  twin-argninine leader-binding protein DmsD  28.57 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487956  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.14 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.63 
 
 
201 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  23.03 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.25 
 
 
238 aa  55.8  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  25.55 
 
 
215 aa  55.5  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06850  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.67 
 
 
235 aa  55.5  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1677  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27.73 
 
 
204 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0685964  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.06 
 
 
214 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.78 
 
 
221 aa  52.4  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2279  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.16 
 
 
200 aa  52  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2547  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.54 
 
 
199 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0265649  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  27.08 
 
 
186 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.56 
 
 
229 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2104  cytoplasmic chaperone  29.52 
 
 
216 aa  51.6  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4423  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.77 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1451  putative cytoplasmic chaperone TorD  25.33 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.49 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.06 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  24.75 
 
 
186 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  24.75 
 
 
186 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  29.73 
 
 
186 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  29.73 
 
 
186 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.19 
 
 
231 aa  48.5  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3615  TorA specific chaperone, putative  26.02 
 
 
221 aa  48.5  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1230  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25 
 
 
196 aa  48.5  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.136646  normal  0.468317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4815  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.17 
 
 
230 aa  48.5  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1234  chaperone protein TorD  24.58 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.713682  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.15 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  28.76 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.9 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1182  hypothetical protein  27.78 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3718  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.91 
 
 
225 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3789  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.91 
 
 
225 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.08 
 
 
211 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3914  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.41 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.41 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.41 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.41 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  23.78 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.36 
 
 
212 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1116  chaperone protein TorD  23.73 
 
 
199 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.96 
 
 
189 aa  46.6  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>