173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1323 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  100 
 
 		 220 aa  443  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  56.73 
 
 		 215 aa  258  6e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  56.73 
 
 		 215 aa  257  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  47.17 
 
 		 215 aa  209  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2316  chaperone protein TorD  39 
 
 		 199 aa  131  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01001  chaperone protein TorD  38.5 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01008  hypothetical protein  38.5 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1109  chaperone protein TorD  38.5 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1116  chaperone protein TorD  38.5 
 
 		 199 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2644  cytoplasmic chaperone TorD family protein  38.5 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.437385  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1234  chaperone protein TorD  38.5 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.713682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2597  chaperone protein TorD  38.5 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.382681 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2126  chaperone protein TorD  39 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4153  chaperone protein TorD  38.94 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.39248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4211  chaperone protein TorD  38.94 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4104  chaperone protein TorD  38.94 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4049  chaperone protein TorD  39.02 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4032  chaperone protein TorD  37.5 
 
 		 210 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1231  chaperone protein TorD  38.53 
 
 		 217 aa  124  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  35.43 
 
 		 223 aa  124  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  39.22 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  39.22 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  39.22 
 
 		 209 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  38.73 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  36.49 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1050  chaperone protein TorD  37.67 
 
 		 209 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1115  chaperone protein TorD  37.21 
 
 		 209 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1054  chaperone protein TorD  37.56 
 
 		 209 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2732  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.41 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  37.68 
 
 		 215 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.16 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  33.94 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1834  chaperone protein TorD  31.38 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2799  chaperone protein TorD  35.24 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.011442 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4217  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.53 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.154602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0986  chaperone protein TorD  30 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.47 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.08 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1674  chaperone protein TorD  31.5 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00649542  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3382  cytoplasmic chaperone TorD  27.6 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.42 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0657  DMSO-membrane protein  28.95 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.527505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1750  cytoplasmic chaperone TorD  28.79 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3774  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.96 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.416622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.12 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.56 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.95 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3047  DMSO-membrane protein  25.48 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.04 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  31.13 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.82 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  26.79 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2317  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, Rieske 2Fe-2S subunit  30.16 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.17 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3201  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.06 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.634799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  31.37 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.86 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.51 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.01 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  31.3 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.28 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  26.13 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1876  cytoplasmic chaperone TorD  29.47 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3615  TorA specific chaperone, putative  26.15 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  31.13 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  31.13 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  31.13 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  33.11 
 
 		 186 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  31.34 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.33 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1122  putative chaperone, formate dehydrogenase-specific  27.41 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1182  hypothetical protein  23.74 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  24.26 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003496  putative formate dehydrogenase-specific chaperone  25.13 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.21 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.81 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2402  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.71 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.54828 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.92 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30.28 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.683662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.75 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4139  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.88 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.19 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3718  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.89 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4134  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.34 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.75 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.06 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.49 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02275  hypothetical protein  25.77 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.49 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.49 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18510  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.05 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4507  TorA specific chaperone, putative  25.89 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3914  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.49 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3789  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.13 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2104  cytoplasmic chaperone  27.34 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.03 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0502  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.02 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0399  cytoplasmic chaperone TorD  25.64 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.372302  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>