61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1234 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1234  chaperone protein TorD  100 
 
 
199 aa  408  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.713682  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2644  cytoplasmic chaperone TorD family protein  96.98 
 
 
199 aa  394  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.437385  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01001  chaperone protein TorD  95.98 
 
 
199 aa  388  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01008  hypothetical protein  95.98 
 
 
199 aa  388  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1109  chaperone protein TorD  95.98 
 
 
199 aa  388  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1116  chaperone protein TorD  95.48 
 
 
199 aa  388  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2597  chaperone protein TorD  95.98 
 
 
199 aa  388  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.382681 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2316  chaperone protein TorD  95.48 
 
 
199 aa  388  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2126  chaperone protein TorD  94.47 
 
 
199 aa  384  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4032  chaperone protein TorD  63.92 
 
 
210 aa  248  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4153  chaperone protein TorD  63.4 
 
 
210 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.39248  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4104  chaperone protein TorD  63.4 
 
 
210 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4049  chaperone protein TorD  63.4 
 
 
210 aa  244  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4211  chaperone protein TorD  62.89 
 
 
210 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  38.5 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  36.04 
 
 
215 aa  129  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  34.33 
 
 
215 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  34.91 
 
 
215 aa  122  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1054  chaperone protein TorD  35.64 
 
 
209 aa  111  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1050  chaperone protein TorD  35.82 
 
 
209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  33.66 
 
 
218 aa  104  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1115  chaperone protein TorD  35.15 
 
 
209 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  33.5 
 
 
209 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  33.5 
 
 
209 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  33.5 
 
 
204 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1231  chaperone protein TorD  33.66 
 
 
217 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  32.99 
 
 
209 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2732  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.06 
 
 
237 aa  99  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  33.99 
 
 
221 aa  98.2  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  33 
 
 
223 aa  97.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4217  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.69 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.154602  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2799  chaperone protein TorD  33.65 
 
 
211 aa  91.7  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.011442 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.5 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  32.98 
 
 
215 aa  89.4  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1834  chaperone protein TorD  26.46 
 
 
236 aa  85.9  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1674  chaperone protein TorD  32.66 
 
 
193 aa  84.7  8e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00649542  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0986  chaperone protein TorD  31.12 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1876  cytoplasmic chaperone TorD  35.65 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3774  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.15 
 
 
226 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.416622  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3382  cytoplasmic chaperone TorD  26.8 
 
 
224 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260043  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3047  DMSO-membrane protein  25.64 
 
 
226 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1284  cytoplasmic chaperone TorD  32.43 
 
 
203 aa  58.2  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1750  cytoplasmic chaperone TorD  27.46 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0657  DMSO-membrane protein  30.61 
 
 
211 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527505 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.7 
 
 
195 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.86 
 
 
229 aa  51.6  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  28.69 
 
 
186 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.6 
 
 
226 aa  48.1  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  28.69 
 
 
186 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.58 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  27.87 
 
 
186 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  27.05 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  27.05 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.12 
 
 
225 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3124  cytoplasmic chaperone TorD  29.57 
 
 
260 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.34 
 
 
238 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  23.53 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.41 
 
 
214 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  21.55 
 
 
209 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.43 
 
 
212 aa  41.6  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  24.19 
 
 
236 aa  41.6  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>