124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1993 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  100 
 
 		 218 aa  447  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  64.71 
 
 		 223 aa  258  6e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  57.08 
 
 		 215 aa  250  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  58.06 
 
 		 221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  56.04 
 
 		 204 aa  232  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  55.29 
 
 		 209 aa  231  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  55.29 
 
 		 209 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  55.56 
 
 		 209 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1054  chaperone protein TorD  55.34 
 
 		 209 aa  224  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2799  chaperone protein TorD  52.8 
 
 		 211 aa  219  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.011442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1050  chaperone protein TorD  53.52 
 
 		 209 aa  218  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1231  chaperone protein TorD  53.37 
 
 		 217 aa  217  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1115  chaperone protein TorD  54.37 
 
 		 209 aa  217  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1834  chaperone protein TorD  43.78 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0986  chaperone protein TorD  38.67 
 
 		 235 aa  131  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  36.49 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  33.64 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  30.41 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  30.56 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1116  chaperone protein TorD  33.83 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2597  chaperone protein TorD  33.33 
 
 		 199 aa  105  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.382681 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01001  chaperone protein TorD  33.33 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2644  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.33 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.437385  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01008  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1109  chaperone protein TorD  33.33 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1234  chaperone protein TorD  33.66 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.713682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2316  chaperone protein TorD  32.84 
 
 		 199 aa  101  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2126  chaperone protein TorD  32.34 
 
 		 199 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2732  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.68 
 
 		 237 aa  88.6  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.36 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4032  chaperone protein TorD  31.5 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4104  chaperone protein TorD  31.5 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4153  chaperone protein TorD  31.5 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.39248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4211  chaperone protein TorD  31.5 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4049  chaperone protein TorD  31.5 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1674  chaperone protein TorD  35.26 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00649542  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1876  cytoplasmic chaperone TorD  27.66 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.82 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4217  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.93 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.154602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  24.88 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  25 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.3 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.56 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.23 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3718  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.29 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3789  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.81 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3914  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.29 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.52 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.37 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.52 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.52 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  26.58 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4134  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.26 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  25.95 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  25.95 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  25.91 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.67 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  25.95 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  26.62 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4507  TorA specific chaperone, putative  23.81 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.81 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.75 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.67 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.13 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.83 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0057  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.59 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.17 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.27 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2763  cytoplasmic chaperone TorD  25.23 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.85 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4423  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.12 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.61 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.68 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.8 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.58 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  21.56 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4139  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.08 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3047  DMSO-membrane protein  26.49 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0360  Putative anaerobic dehydrogenase-like component  28.5 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.2 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.34 
 
 		 229 aa  48.9  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.21 
 
 		 237 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27.5 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1122  putative chaperone, formate dehydrogenase-specific  23.11 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2052  TorD family cytoplasmic chaperone  26.18 
 
 		 186 aa  48.9  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2445  TorD family cytoplasmic chaperone  26.18 
 
 		 186 aa  48.9  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2164  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.18 
 
 		 186 aa  48.9  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.063946  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.9 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1284  cytoplasmic chaperone TorD  30.61 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3382  cytoplasmic chaperone TorD  23 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3774  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.83 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.416622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  23.26 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4815  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.35 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  21.05 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.48 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.06 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  21.5 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2279  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.65 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>