96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2445 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2445  TorD family cytoplasmic chaperone  100 
 
 
186 aa  377  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2164  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 
186 aa  377  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.063946  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2052  TorD family cytoplasmic chaperone  100 
 
 
186 aa  377  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1935  cytoplasmic chaperone TorD family protein  72.78 
 
 
195 aa  277  7e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161527  hitchhiker  0.00430197 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  70.88 
 
 
189 aa  260  6.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1551  cytoplasmic chaperone TorD family protein  65.93 
 
 
184 aa  255  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.143271  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1248  chaperone, TorD family  66.48 
 
 
184 aa  252  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1233  TorD family chaperone  66.48 
 
 
184 aa  252  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2053  chaperone, TorD family  66.48 
 
 
184 aa  252  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.110263  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2236  chaperone, TorD family  66.48 
 
 
184 aa  252  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.68342 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2564  cytoplasmic chaperone TorD family protein  65.93 
 
 
184 aa  252  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.241969 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2610  cytoplasmic chaperone TorD family protein  65.93 
 
 
184 aa  252  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000111004  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1413  chaperone, TorD family  65.93 
 
 
184 aa  252  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0753019 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01039  hypothetical protein  65.93 
 
 
184 aa  251  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2294  chaperone, TorD family  65.93 
 
 
184 aa  251  5.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.250336  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01032  hypothetical protein  65.93 
 
 
184 aa  251  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.77975  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1154  chaperone TorD  65.93 
 
 
184 aa  251  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1153  chaperone TorD  65.93 
 
 
184 aa  251  5.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120482  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1203  chaperone, TorD family  65.93 
 
 
184 aa  251  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2098  chaperone TorD  66.29 
 
 
184 aa  244  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1799  cytoplasmic chaperone TorD family protein  68.97 
 
 
192 aa  243  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2076  cytoplasmic chaperone TorD family protein  67.04 
 
 
190 aa  239  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.370071  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2279  cytoplasmic chaperone TorD family protein  67.98 
 
 
200 aa  236  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0574  oxidoreductase component  43.48 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2039  twin-argninine leader-binding protein DmsD  31.87 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1664  twin-argninine leader-binding protein DmsD  31.87 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01560  twin-argninine leader-binding protein for DmsA and TorA  31.87 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2052  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.87 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01550  hypothetical protein  31.87 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2300  twin-argninine leader-binding protein DmsD  31.87 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0130846 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1798  twin-argninine leader-binding protein DmsD  31.87 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1777  twin-argninine leader-binding protein DmsD  32.42 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1609  twin-argninine leader-binding protein DmsD  32.24 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.81 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.62 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1925  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.44 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  32.46 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1677  twin-argninine leader-binding protein DmsD  32.26 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0685964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1844  twin-argninine leader-binding protein DmsD  32.26 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487956  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1665  twin-argninine leader-binding protein DmsD  31.72 
 
 
204 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.95 
 
 
221 aa  63.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1597  twin-argninine leader-binding protein DmsD  31.72 
 
 
204 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  0.929764 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1606  twin-argninine leader-binding protein DmsD  31.72 
 
 
204 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3391  twin-argninine leader-binding protein DmsD  28.91 
 
 
236 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3258  twin-argninine leader-binding protein DmsD  28.64 
 
 
226 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.92 
 
 
219 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4654  oxidoreductase component  31.82 
 
 
197 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1309  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.71 
 
 
204 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000480203 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0919  twin-argninine leader-binding protein DmsD  28.91 
 
 
236 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507185  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1431  hypothetical protein  28.42 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2352  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.03 
 
 
204 aa  58.5  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  31.44 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1341  TorD family cytoplasmic chaperone  32.61 
 
 
221 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.37 
 
 
221 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.5 
 
 
237 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1453  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.07 
 
 
198 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2719  TorD family cytoplasmic chaperone  32.07 
 
 
224 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.47 
 
 
219 aa  54.3  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1406  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.32 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  29.69 
 
 
221 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.4 
 
 
225 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  30.27 
 
 
223 aa  52.4  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1050  chaperone protein TorD  32.8 
 
 
209 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.14 
 
 
207 aa  51.6  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  26.88 
 
 
203 aa  51.6  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3263  cytoplasmic chaperone TorD  28.99 
 
 
207 aa  51.2  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.852314  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  25 
 
 
209 aa  51.2  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2921  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.41 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  26.18 
 
 
218 aa  48.9  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.78 
 
 
219 aa  48.5  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003496  putative formate dehydrogenase-specific chaperone  27.98 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3124  cytoplasmic chaperone TorD  29.17 
 
 
260 aa  45.1  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.04 
 
 
217 aa  44.7  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3682  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.87 
 
 
219 aa  44.7  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.966559  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 
211 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.51 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1866  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.65 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0320246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  28.45 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.51 
 
 
219 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4064  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.33 
 
 
205 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5493  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.05 
 
 
235 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  29.31 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2447  cytoplasmic chaperone TorD  28.95 
 
 
222 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1838  hypothetical protein  31.09 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00520  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  22.55 
 
 
212 aa  43.1  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  28.45 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0399  cytoplasmic chaperone TorD  25.95 
 
 
208 aa  42.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.372302  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  21.96 
 
 
221 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  28.78 
 
 
215 aa  42.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2181  sulfur reductase  31.09 
 
 
188 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.489314  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02275  hypothetical protein  27.38 
 
 
210 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  29.01 
 
 
186 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 
211 aa  41.6  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1167  hypothetical protein  29.03 
 
 
208 aa  41.6  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  28.45 
 
 
186 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>