103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1341 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1341  TorD family cytoplasmic chaperone  100 
 
 
221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2719  TorD family cytoplasmic chaperone  98.64 
 
 
224 aa  447  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1453  cytoplasmic chaperone TorD family protein  98.48 
 
 
198 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4654  oxidoreductase component  47.72 
 
 
197 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  40.1 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  40.32 
 
 
205 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1925  twin-argninine leader-binding protein DmsD  35.23 
 
 
204 aa  102  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  37.14 
 
 
203 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01560  twin-argninine leader-binding protein for DmsA and TorA  34.55 
 
 
204 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2052  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.55 
 
 
204 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1664  twin-argninine leader-binding protein DmsD  34.55 
 
 
204 aa  102  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2039  twin-argninine leader-binding protein DmsD  34.55 
 
 
204 aa  102  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2300  twin-argninine leader-binding protein DmsD  34.55 
 
 
204 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0130846 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01550  hypothetical protein  34.55 
 
 
204 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1798  twin-argninine leader-binding protein DmsD  34.55 
 
 
204 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1609  twin-argninine leader-binding protein DmsD  34.55 
 
 
204 aa  101  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3258  twin-argninine leader-binding protein DmsD  37.44 
 
 
226 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3391  twin-argninine leader-binding protein DmsD  36.97 
 
 
236 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1777  twin-argninine leader-binding protein DmsD  34.03 
 
 
204 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2352  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.69 
 
 
204 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0919  twin-argninine leader-binding protein DmsD  36.02 
 
 
236 aa  95.1  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507185  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1606  twin-argninine leader-binding protein DmsD  34.55 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1665  twin-argninine leader-binding protein DmsD  34.55 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1597  twin-argninine leader-binding protein DmsD  34.55 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  0.929764 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1677  twin-argninine leader-binding protein DmsD  34.55 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0685964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1844  twin-argninine leader-binding protein DmsD  34.55 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487956  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.86 
 
 
219 aa  85.5  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.66 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1406  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.35 
 
 
206 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1309  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.85 
 
 
204 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000480203 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  31 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.06 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2921  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.14 
 
 
218 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.72 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.21 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.16 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06850  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  31.16 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224601 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  29.58 
 
 
209 aa  62.8  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1935  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.69 
 
 
195 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161527  hitchhiker  0.00430197 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  31.11 
 
 
226 aa  59.3  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.33 
 
 
221 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.8 
 
 
189 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3682  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.53 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.966559  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2052  TorD family cytoplasmic chaperone  32.61 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2445  TorD family cytoplasmic chaperone  32.61 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2164  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.61 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.063946  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1431  hypothetical protein  29.93 
 
 
221 aa  56.6  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1233  TorD family chaperone  30.32 
 
 
184 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1248  chaperone, TorD family  30.32 
 
 
184 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2053  chaperone, TorD family  30.32 
 
 
184 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.110263  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2236  chaperone, TorD family  30.32 
 
 
184 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.68342 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.82 
 
 
228 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2610  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.25 
 
 
184 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000111004  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2564  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.25 
 
 
184 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.241969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2098  chaperone TorD  30.25 
 
 
184 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  29.77 
 
 
186 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  29.77 
 
 
186 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.49 
 
 
229 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.51 
 
 
237 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1230  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.51 
 
 
196 aa  55.8  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.136646  normal  0.468317 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.29 
 
 
221 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  29.01 
 
 
186 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  40.62 
 
 
186 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  40.62 
 
 
186 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1203  chaperone, TorD family  29.79 
 
 
184 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.15 
 
 
241 aa  55.1  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2104  cytoplasmic chaperone  30.3 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0356  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.04 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0328008  hitchhiker  0.00751458 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01032  hypothetical protein  29.63 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.77975  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1153  chaperone TorD  29.63 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120482  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1154  chaperone TorD  29.63 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2294  chaperone, TorD family  29.63 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.250336  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01039  hypothetical protein  29.63 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1413  chaperone, TorD family  29.63 
 
 
184 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0753019 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00520  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30.28 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  30.43 
 
 
236 aa  51.6  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2732  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.78 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1551  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.83 
 
 
184 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.143271  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.46 
 
 
229 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3864  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.68 
 
 
206 aa  48.9  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0799961  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1231  chaperone protein TorD  26.37 
 
 
217 aa  48.5  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.81 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.53 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.43 
 
 
221 aa  47  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2471  cytoplasmic chaperone TorD family protein  46.97 
 
 
243 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.43 
 
 
219 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.64 
 
 
211 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.51 
 
 
234 aa  45.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1609  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.06 
 
 
284 aa  45.1  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1913  cytoplasmic chaperone TorD  29.2 
 
 
235 aa  45.1  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2076  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.09 
 
 
190 aa  45.1  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.370071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.27 
 
 
195 aa  45.1  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.12 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.4 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2279  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.47 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1799  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.22 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1054  chaperone protein TorD  25.42 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  28.19 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>