77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1233 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1233  TorD family chaperone  100 
 
 		 184 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1248  chaperone, TorD family  100 
 
 		 184 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1203  chaperone, TorD family  99.46 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2053  chaperone, TorD family  100 
 
 		 184 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.110263  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2236  chaperone, TorD family  100 
 
 		 184 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.68342 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2564  cytoplasmic chaperone TorD family protein  86.41 
 
 		 184 aa  337  4e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.241969 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2610  cytoplasmic chaperone TorD family protein  86.41 
 
 		 184 aa  337  4e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000111004  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1413  chaperone, TorD family  85.87 
 
 		 184 aa  334  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753019 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01032  hypothetical protein  85.33 
 
 		 184 aa  332  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.77975  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1154  chaperone TorD  85.33 
 
 		 184 aa  332  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2294  chaperone, TorD family  85.33 
 
 		 184 aa  332  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.250336  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1153  chaperone TorD  85.33 
 
 		 184 aa  332  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01039  hypothetical protein  85.33 
 
 		 184 aa  332  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2098  chaperone TorD  87.43 
 
 		 184 aa  326  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1551  cytoplasmic chaperone TorD family protein  82.61 
 
 		 184 aa  325  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.143271  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1935  cytoplasmic chaperone TorD family protein  69.35 
 
 		 195 aa  278  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161527  hitchhiker  0.00430197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2052  TorD family cytoplasmic chaperone  66.48 
 
 		 186 aa  252  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2164  cytoplasmic chaperone TorD family protein  66.48 
 
 		 186 aa  252  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.063946  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2445  TorD family cytoplasmic chaperone  66.48 
 
 		 186 aa  252  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  64.67 
 
 		 189 aa  246  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1799  cytoplasmic chaperone TorD family protein  62.64 
 
 		 192 aa  229  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2279  cytoplasmic chaperone TorD family protein  60.67 
 
 		 200 aa  222  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2076  cytoplasmic chaperone TorD family protein  60.11 
 
 		 190 aa  222  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.370071  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0574  oxidoreductase component  35.29 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2300  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0130846 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01550  hypothetical protein  30 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01560  twin-argninine leader-binding protein for DmsA and TorA  30 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2039  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2052  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1664  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1798  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1777  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1925  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.21 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.19 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1609  twin-argninine leader-binding protein DmsD  28.89 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30.89 
 
 		 211 aa  67  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2352  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.22 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27.89 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3391  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27.54 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1844  twin-argninine leader-binding protein DmsD  28.49 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1309  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.14 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000480203 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1677  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.61 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0685964  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1597  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27.93 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  0.929764 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1665  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27.93 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1606  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27.93 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3258  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27.05 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4654  oxidoreductase component  29.41 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0919  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27.05 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1341  TorD family cytoplasmic chaperone  30.32 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.75 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2719  TorD family cytoplasmic chaperone  29.79 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1453  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.79 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1431  hypothetical protein  26.32 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.5 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.32 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.74 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5276  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.08 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  24.19 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  31.11 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  29.63 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  31.11 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.33 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  29.63 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.6 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00520  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  23.16 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.63 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  29.63 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2921  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.12 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1406  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.6 
 
 		 206 aa  44.7  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1866  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.65 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320246 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25 
 
 		 219 aa  44.7  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0240  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.06 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.15 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06850  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  24.31 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224601 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.29 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2547  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.4 
 
 		 199 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0265649  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0530  hypothetical protein  24.04 
 
 		 182 aa  41.6  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.280074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>