29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1838 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2181  sulfur reductase  100 
 
 		 188 aa  337  4e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.489314  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1838  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  334  3.9999999999999995e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0951  hypothetical protein  32.31 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.180933  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1909  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  33.02 
 
 		 179 aa  51.2  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1866  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320246 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2045  hypothetical protein  28.68 
 
 		 199 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.362778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0567  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  30.39 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1338  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.18 
 
 		 193 aa  48.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  28.38 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2279  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.03 
 
 		 200 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0680  cytoplasmic chaperone TorD  31.67 
 
 		 210 aa  45.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1935  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.85 
 
 		 195 aa  45.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161527  hitchhiker  0.00430197 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2763  cytoplasmic chaperone TorD  31.75 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2052  TorD family cytoplasmic chaperone  31.09 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2445  TorD family cytoplasmic chaperone  31.09 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2164  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.09 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.063946  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2076  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.18 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.370071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2294  chaperone, TorD family  27.55 
 
 		 184 aa  42  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.250336  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1413  chaperone, TorD family  27.55 
 
 		 184 aa  42  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753019 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1154  chaperone TorD  27.55 
 
 		 184 aa  42  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01039  hypothetical protein  27.55 
 
 		 184 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1153  chaperone TorD  27.55 
 
 		 184 aa  42  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120482  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01032  hypothetical protein  27.55 
 
 		 184 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.77975  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2098  chaperone TorD  27.55 
 
 		 184 aa  41.6  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.78 
 
 		 189 aa  41.6  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2564  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.55 
 
 		 184 aa  41.2  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.241969 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2610  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.55 
 
 		 184 aa  41.2  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000111004  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1799  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.22 
 
 		 192 aa  40.8  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>