87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1909 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1909  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  100 
 
 
179 aa  367  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0567  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  60.23 
 
 
175 aa  223  1e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1777  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  33.33 
 
 
182 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2172  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  33.33 
 
 
182 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1706  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  32.48 
 
 
182 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.887817  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0331  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  27.12 
 
 
206 aa  58.2  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000424916 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1332  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  36.64 
 
 
259 aa  57.4  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5443  respiratory nitrate reductase, delta subunit  31.93 
 
 
208 aa  54.7  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247516  normal  0.223039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1489  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  34.51 
 
 
217 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1529  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  27.81 
 
 
183 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139315  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3140  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  31.09 
 
 
207 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121684  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2181  sulfur reductase  33.02 
 
 
188 aa  51.6  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.489314  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1838  hypothetical protein  33.02 
 
 
166 aa  51.2  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1826  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  42.42 
 
 
237 aa  50.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.909351  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3701  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  35.45 
 
 
221 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03845  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  37.36 
 
 
246 aa  50.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1237  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  30.95 
 
 
248 aa  50.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.837761  normal  0.358229 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0205  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  25 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1922  nitrate reductase delta subunit protein  27.27 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2881  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  31.67 
 
 
240 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0335  hypothetical protein  27.57 
 
 
222 aa  49.3  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3401  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  30.71 
 
 
181 aa  48.9  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2805  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  36.78 
 
 
242 aa  48.9  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.0319013 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2633  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  28.26 
 
 
182 aa  48.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2137  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  36.62 
 
 
177 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0316  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  31.4 
 
 
206 aa  47.8  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0507  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  34.45 
 
 
226 aa  47.4  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.993559  normal  0.350647 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1973  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  37.5 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2277  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  36.11 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1773  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  34.45 
 
 
239 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0856492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3178  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  36.11 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2160  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  36.11 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1979  nitrate reductase delta chain  33.33 
 
 
176 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1956  nitrate reductase, delta subunit  36.11 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0503251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1934  nitrate reductase, delta subunit  36.62 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.395358  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3446  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  31.21 
 
 
342 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501615  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1405  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  24.81 
 
 
215 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.688747  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2127  nitrate reductase delta chain  33.33 
 
 
176 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2234  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  56.1 
 
 
226 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1985  respiratory nitrate reductase, delta subunit  29.73 
 
 
196 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2038  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  30.77 
 
 
207 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1852  nitrate reductase, delta subunit  31.01 
 
 
234 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1761  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  32.31 
 
 
226 aa  45.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.441918  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2467  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  31.53 
 
 
191 aa  45.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4234  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  52.38 
 
 
229 aa  45.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0808187  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2419  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  31.53 
 
 
191 aa  45.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2627  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  31.54 
 
 
234 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.396809  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0194  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  31.97 
 
 
223 aa  45.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107326  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2562  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  29.73 
 
 
239 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01436  hypothetical protein  31.37 
 
 
231 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2181  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  31.37 
 
 
231 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.283528  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3084  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  50 
 
 
246 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.767842  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0179  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  30.83 
 
 
223 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0273  respiratory nitrate reductase, delta subunit  28.38 
 
 
235 aa  43.9  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11188  respiratory nitrate reductase delta subunit narJ  32.46 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1550  respiratory nitrate reductase 2 delta chain  31.37 
 
 
231 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1647  respiratory nitrate reductase 2 delta chain  31.37 
 
 
231 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2190  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  31.37 
 
 
231 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0297  respiratory nitrate reductase, delta subunit  28.38 
 
 
235 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01424  nitrate reductase 2 (NRZ), delta subunit (assembly subunit)  31.37 
 
 
231 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1855  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  33.33 
 
 
239 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2076  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone 2  31.37 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4476  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  28.24 
 
 
223 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0777  nitrate reductase, delta subunit  31.09 
 
 
342 aa  42.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0668  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  51.22 
 
 
287 aa  42.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1001  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  31.33 
 
 
231 aa  42  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.873205  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2590  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  34.04 
 
 
248 aa  42  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1251  nitrate reductase, delta subunit  28.57 
 
 
230 aa  42.4  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1708  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone 2  30.39 
 
 
231 aa  42  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430255 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3866  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  47.62 
 
 
239 aa  41.6  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.727762  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4427  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  26.36 
 
 
244 aa  41.6  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205722  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.29 
 
 
213 aa  41.6  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2759  nitrate reductase, delta subunit  30.58 
 
 
238 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.639907  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1582  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone 2  29.41 
 
 
231 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.514226  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1763  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone 2  29.41 
 
 
231 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2243  nitrate reductase, delta subunit  30.08 
 
 
234 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0183466  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1956  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  43.9 
 
 
244 aa  41.2  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.389799 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3075  nitrate reductase, delta subunit  30.08 
 
 
234 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.416699  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2683  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  30.08 
 
 
234 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1694  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone 2  29.41 
 
 
231 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.610532 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1733  nitrate reductase, delta subunit  30.08 
 
 
234 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1516  nitrate reductase, delta subunit  30.08 
 
 
234 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.230048  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2064  respiratory nitrate reductase chaperone NarJ  31.65 
 
 
231 aa  41.2  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2257  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  31.45 
 
 
239 aa  41.2  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0418828  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5709  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  28.8 
 
 
233 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.839113  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1757  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone 2  29.41 
 
 
231 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196213  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2632  nitrate reductase molybdenum cofactor assembly chaperone  26.85 
 
 
243 aa  40.8  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.227411  normal  0.019972 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>