65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1338 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1338  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 		 193 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2045  hypothetical protein  56.25 
 
 		 199 aa  211  3.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.362778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0951  hypothetical protein  51.7 
 
 		 192 aa  210  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.180933  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1866  cytoplasmic chaperone TorD family protein  50.58 
 
 		 203 aa  179  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320246 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2402  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.16 
 
 		 180 aa  94.7  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  29.83 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  29.44 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.62 
 
 		 202 aa  72  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0368471 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22270  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  35.17 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1899  hypothetical protein  27.75 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.65 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.27 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.88 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  32.19 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.683662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  29.15 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.34 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.36 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0546  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.86 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2104  cytoplasmic chaperone  31.85 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.94 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  31.29 
 
 		 244 aa  54.3  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2354  anaerobic dehydrogenase-like protein  26.34 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2317  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, Rieske 2Fe-2S subunit  27.09 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.88 
 
 		 250 aa  52  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  30.77 
 
 		 231 aa  51.6  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.74 
 
 		 229 aa  51.6  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.49 
 
 		 229 aa  51.2  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.08 
 
 		 239 aa  51.2  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.53 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30.65 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000683605 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.61 
 
 		 222 aa  49.7  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.46 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2181  sulfur reductase  24.18 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.489314  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  23.78 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1609  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.18 
 
 		 284 aa  48.5  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1838  hypothetical protein  24.18 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17900  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.49 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.256689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2402  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.23 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.54828 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3661  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.5 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3049  hypothetical protein  28.34 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.729916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.5 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2368  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.07 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.447639  normal  0.379865 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  24.48 
 
 		 252 aa  45.4  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2471  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.62 
 
 		 243 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0677  hypothetical protein  36.59 
 
 		 222 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.178124  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.61 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 		 226 aa  44.7  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  30.47 
 
 		 220 aa  44.7  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00520  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25 
 
 		 212 aa  44.7  0.0009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2243  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.16 
 
 		 189 aa  44.7  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.33 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.03 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.46 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  28.32 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2380  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.66 
 
 		 232 aa  43.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.434719 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1651  anaerobic dehydrogenase-like protein  29.17 
 
 		 270 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0335  hypothetical protein  24.23 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.08 
 
 		 229 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.23 
 
 		 233 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1563  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.39 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.548826  normal  0.822991 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.57 
 
 		 207 aa  42  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.65 
 
 		 219 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1230  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.07 
 
 		 196 aa  41.2  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.136646  normal  0.468317 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0930  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 		 240 aa  41.2  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.542381 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1750  cytoplasmic chaperone TorD  30.33 
 
 		 208 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>