100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2243 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2243  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 
189 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1230  cytoplasmic chaperone TorD family protein  41.28 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.136646  normal  0.468317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  40.36 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  39.16 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  39.16 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  40.36 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2471  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.79 
 
 
243 aa  115  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  38.55 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0930  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.32 
 
 
240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.542381 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0546  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.6 
 
 
219 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  38.24 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2317  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, Rieske 2Fe-2S subunit  30.66 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  32.43 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.33 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.91 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.14 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2104  cytoplasmic chaperone  30.69 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.68 
 
 
229 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.68 
 
 
214 aa  63.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.52 
 
 
229 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.33 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0951  hypothetical protein  34.81 
 
 
192 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.180933  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.23 
 
 
217 aa  62  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1338  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.16 
 
 
193 aa  61.2  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.7 
 
 
238 aa  61.2  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00520  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.95 
 
 
212 aa  60.5  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.5 
 
 
233 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3661  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.97 
 
 
210 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.78 
 
 
210 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4213  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25 
 
 
195 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  32.06 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.683662  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  31.25 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.82 
 
 
234 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0240  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.03 
 
 
204 aa  57.4  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  30.48 
 
 
203 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.95 
 
 
195 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.46 
 
 
228 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.49 
 
 
229 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27270  hypothetical protein  28.06 
 
 
284 aa  56.6  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  27.03 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1609  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.96 
 
 
284 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2547  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.91 
 
 
199 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0265649  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0919  twin-argninine leader-binding protein DmsD  28.37 
 
 
236 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507185  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3258  twin-argninine leader-binding protein DmsD  28.37 
 
 
226 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3391  twin-argninine leader-binding protein DmsD  28.37 
 
 
236 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2045  hypothetical protein  32.56 
 
 
199 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.362778  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.68 
 
 
213 aa  54.7  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.37 
 
 
222 aa  54.7  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.48 
 
 
239 aa  52.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  28.46 
 
 
215 aa  52.8  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  26.85 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  32.43 
 
 
220 aa  52  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.76 
 
 
221 aa  51.6  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2732  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.82 
 
 
237 aa  51.2  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1777  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.73 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1609  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.73 
 
 
204 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  28.16 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2039  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.73 
 
 
204 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2300  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.73 
 
 
204 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0130846 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01560  twin-argninine leader-binding protein for DmsA and TorA  29.73 
 
 
204 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01550  hypothetical protein  29.73 
 
 
204 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.77 
 
 
205 aa  49.7  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1664  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.73 
 
 
204 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2052  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.73 
 
 
204 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06160  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  30.09 
 
 
250 aa  48.9  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18510  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  31.62 
 
 
230 aa  49.3  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.13 
 
 
212 aa  48.9  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1925  twin-argninine leader-binding protein DmsD  29.46 
 
 
204 aa  48.9  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1677  twin-argninine leader-binding protein DmsD  32.76 
 
 
204 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0685964  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1597  twin-argninine leader-binding protein DmsD  33.33 
 
 
204 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  0.929764 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1665  twin-argninine leader-binding protein DmsD  33.33 
 
 
204 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1798  twin-argninine leader-binding protein DmsD  30.56 
 
 
204 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1606  twin-argninine leader-binding protein DmsD  33.33 
 
 
204 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1844  twin-argninine leader-binding protein DmsD  33.33 
 
 
204 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487956  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1866  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.86 
 
 
203 aa  48.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0320246 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.04 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1453  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.21 
 
 
198 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.75 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.98 
 
 
204 aa  46.2  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2352  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.52 
 
 
204 aa  46.2  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1563  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.89 
 
 
226 aa  46.2  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.548826  normal  0.822991 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2719  TorD family cytoplasmic chaperone  31.65 
 
 
224 aa  46.2  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1341  TorD family cytoplasmic chaperone  31.65 
 
 
221 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.17 
 
 
190 aa  45.1  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.57 
 
 
252 aa  45.1  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4654  oxidoreductase component  32 
 
 
197 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2354  anaerobic dehydrogenase-like protein  31.71 
 
 
210 aa  44.7  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1192  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.09 
 
 
285 aa  43.9  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.563307  normal  0.32454 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.52 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0368471 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06850  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.81 
 
 
235 aa  43.9  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224601 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  29.31 
 
 
231 aa  43.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1284  cytoplasmic chaperone TorD  27.83 
 
 
203 aa  43.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1876  cytoplasmic chaperone TorD  31.78 
 
 
213 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2402  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.68 
 
 
213 aa  42  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.54828 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2921  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.76 
 
 
218 aa  41.6  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.17 
 
 
244 aa  41.6  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.64 
 
 
231 aa  41.2  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.58 
 
 
219 aa  41.2  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3049  hypothetical protein  28.89 
 
 
224 aa  41.2  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.729916  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1116  chaperone protein TorD  30.33 
 
 
199 aa  41.2  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>