92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4213 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4213  cytoplasmic chaperone TorD family protein  100 
 
 		 195 aa  408  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0240  cytoplasmic chaperone TorD family protein  70.77 
 
 		 204 aa  292  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2547  cytoplasmic chaperone TorD family protein  69.74 
 
 		 199 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0265649  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0284  cytoplasmic chaperone TorD family protein  48.45 
 
 		 210 aa  194  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3661  cytoplasmic chaperone TorD family protein  47.94 
 
 		 210 aa  191  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.15 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.77 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  35.12 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.28 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.06 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 		 213 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.88 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  26.32 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.1 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  30.25 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  30.25 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0546  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.34 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.36 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  30.25 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  30.25 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  30.25 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2317  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, Rieske 2Fe-2S subunit  31.47 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.5 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18510  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.47 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.74 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.01 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.08 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.39 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.03 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  24.82 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.683662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.63 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.71 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25 
 
 		 229 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22270  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  26.12 
 
 		 228 aa  52  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2104  cytoplasmic chaperone  30.51 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1230  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.5 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.136646  normal  0.468317 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.69 
 
 		 239 aa  52  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  25 
 
 		 209 aa  51.6  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1651  anaerobic dehydrogenase-like protein  28.97 
 
 		 270 aa  51.6  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.48 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  24.83 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.98 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.23 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  32.38 
 
 		 244 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2921  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.19 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2471  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.27 
 
 		 243 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2606  hypothetical protein  28.8 
 
 		 280 aa  49.3  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.584677 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3682  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.56 
 
 		 219 aa  48.9  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.966559  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  26.28 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1309  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.57 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000480203 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1609  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.5 
 
 		 284 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.39 
 
 		 237 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.67 
 
 		 229 aa  48.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1192  cytoplasmic chaperone TorD family protein  21.88 
 
 		 285 aa  47.8  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.563307  normal  0.32454 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1494  hypothetical protein  29.55 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.6 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.88 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.36 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  24.82 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.06 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  24.68 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2243  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1866  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.41 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320246 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0951  hypothetical protein  26.89 
 
 		 192 aa  45.4  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.180933  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.44 
 
 		 221 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2380  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.36 
 
 		 232 aa  45.1  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.434719 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2052  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.43 
 
 		 204 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01550  hypothetical protein  24.43 
 
 		 204 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01560  twin-argninine leader-binding protein for DmsA and TorA  24.43 
 
 		 204 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2300  twin-argninine leader-binding protein DmsD  24.43 
 
 		 204 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0130846 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1664  twin-argninine leader-binding protein DmsD  24.43 
 
 		 204 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2039  twin-argninine leader-binding protein DmsD  24.43 
 
 		 204 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.44 
 
 		 219 aa  44.7  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1609  twin-argninine leader-binding protein DmsD  25.64 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2354  anaerobic dehydrogenase-like protein  24.07 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  26.89 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1798  twin-argninine leader-binding protein DmsD  24.43 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1431  hypothetical protein  25.19 
 
 		 221 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  23.02 
 
 		 252 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3091  hypothetical protein  25.79 
 
 		 236 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.697478  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1606  twin-argninine leader-binding protein DmsD  31.48 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1665  twin-argninine leader-binding protein DmsD  31.48 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1597  twin-argninine leader-binding protein DmsD  31.48 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  0.929764 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1677  twin-argninine leader-binding protein DmsD  31.48 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0685964  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2368  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.78 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.447639  normal  0.379865 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1844  twin-argninine leader-binding protein DmsD  32.2 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00630  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.23 
 
 		 116 aa  42.4  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  29.23 
 
 		 231 aa  42  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  28.03 
 
 		 236 aa  42  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4222  hypothetical protein  22.31 
 
 		 228 aa  41.6  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000173102  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1777  twin-argninine leader-binding protein DmsD  23.66 
 
 		 204 aa  41.2  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0512  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase-like protein  25.95 
 
 		 313 aa  41.2  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>