156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04330 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  100 
 
 
211 aa  427  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  45.5 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.96 
 
 
217 aa  161  8.000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00520  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  39.23 
 
 
212 aa  158  4e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  43.2 
 
 
205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.16 
 
 
204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3258  twin-argninine leader-binding protein DmsD  36.94 
 
 
226 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01560  twin-argninine leader-binding protein for DmsA and TorA  37.75 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2052  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.75 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2300  twin-argninine leader-binding protein DmsD  37.75 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0130846 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01550  hypothetical protein  37.75 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1664  twin-argninine leader-binding protein DmsD  37.75 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2039  twin-argninine leader-binding protein DmsD  37.75 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0919  twin-argninine leader-binding protein DmsD  36.94 
 
 
236 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507185  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1798  twin-argninine leader-binding protein DmsD  37.75 
 
 
204 aa  129  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1777  twin-argninine leader-binding protein DmsD  37.25 
 
 
204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1609  twin-argninine leader-binding protein DmsD  37.25 
 
 
204 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3391  twin-argninine leader-binding protein DmsD  35.59 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1925  twin-argninine leader-binding protein DmsD  35.85 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2352  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.95 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1606  twin-argninine leader-binding protein DmsD  36.19 
 
 
204 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1665  twin-argninine leader-binding protein DmsD  36.19 
 
 
204 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1597  twin-argninine leader-binding protein DmsD  36.19 
 
 
204 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  0.929764 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1844  twin-argninine leader-binding protein DmsD  36.19 
 
 
204 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487956  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1677  twin-argninine leader-binding protein DmsD  35.71 
 
 
204 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0685964  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06850  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  34.16 
 
 
235 aa  100  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224601 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  29.27 
 
 
203 aa  86.3  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.35 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.09 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1935  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.23 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161527  hitchhiker  0.00430197 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1309  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.22 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000480203 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1230  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.88 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.136646  normal  0.468317 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  29.85 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2921  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.14 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1406  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.1 
 
 
206 aa  72  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1453  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.5 
 
 
198 aa  72  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2719  TorD family cytoplasmic chaperone  31.5 
 
 
224 aa  72  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1341  TorD family cytoplasmic chaperone  31 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2610  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.69 
 
 
184 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000111004  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2564  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.69 
 
 
184 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.241969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4654  oxidoreductase component  31.89 
 
 
197 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.14 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  30.09 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  30.09 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  30.09 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  30.09 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1413  chaperone, TorD family  29.17 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0753019 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2052  TorD family cytoplasmic chaperone  32.46 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2445  TorD family cytoplasmic chaperone  32.46 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2164  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.46 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.063946  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01032  hypothetical protein  29.17 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.77975  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1153  chaperone TorD  29.17 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120482  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1154  chaperone TorD  29.17 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01039  hypothetical protein  29.17 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2294  chaperone, TorD family  29.17 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.250336  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.84 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  30.09 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2053  chaperone, TorD family  30.89 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.110263  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2236  chaperone, TorD family  30.89 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.68342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1233  TorD family chaperone  30.89 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1248  chaperone, TorD family  30.89 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.51 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2098  chaperone TorD  28.88 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.47 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.95 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1609  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.29 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1551  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.08 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.143271  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1203  chaperone, TorD family  30.37 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.35 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.23 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1431  hypothetical protein  27.48 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.71 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3682  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.82 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.966559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.23 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0546  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.47 
 
 
219 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  25.95 
 
 
209 aa  62.4  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.39 
 
 
212 aa  62  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.35 
 
 
225 aa  61.6  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.683662  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.43 
 
 
190 aa  61.6  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.79 
 
 
228 aa  61.6  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.34 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  29.03 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2402  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.97 
 
 
213 aa  60.1  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.54828 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  29.92 
 
 
220 aa  58.5  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0356  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.08 
 
 
206 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0328008  hitchhiker  0.00751458 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2104  cytoplasmic chaperone  29.41 
 
 
216 aa  58.5  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.97 
 
 
229 aa  58.2  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  28.37 
 
 
218 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  27.35 
 
 
209 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.23 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.52 
 
 
229 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2279  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.21 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  27.35 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  27.87 
 
 
221 aa  55.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  26.5 
 
 
209 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3661  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.82 
 
 
210 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0240  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.48 
 
 
204 aa  55.5  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27270  hypothetical protein  27.78 
 
 
284 aa  55.1  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.17 
 
 
225 aa  54.7  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0482  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.37 
 
 
238 aa  54.7  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>