122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1844 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1606  twin-argninine leader-binding protein DmsD  99.51 
 
 		 204 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1665  twin-argninine leader-binding protein DmsD  99.51 
 
 		 204 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1597  twin-argninine leader-binding protein DmsD  99.51 
 
 		 204 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  0.929764 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1677  twin-argninine leader-binding protein DmsD  99.51 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0685964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1844  twin-argninine leader-binding protein DmsD  100 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1609  twin-argninine leader-binding protein DmsD  79.41 
 
 		 204 aa  333  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01560  twin-argninine leader-binding protein for DmsA and TorA  77.45 
 
 		 204 aa  329  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2052  cytoplasmic chaperone TorD family protein  77.45 
 
 		 204 aa  329  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1664  twin-argninine leader-binding protein DmsD  77.45 
 
 		 204 aa  329  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01550  hypothetical protein  77.45 
 
 		 204 aa  329  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2039  twin-argninine leader-binding protein DmsD  77.45 
 
 		 204 aa  329  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2300  twin-argninine leader-binding protein DmsD  77.45 
 
 		 204 aa  329  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0130846 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1798  twin-argninine leader-binding protein DmsD  76.96 
 
 		 204 aa  326  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1777  twin-argninine leader-binding protein DmsD  76.47 
 
 		 204 aa  325  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1925  twin-argninine leader-binding protein DmsD  63.73 
 
 		 204 aa  275  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3391  twin-argninine leader-binding protein DmsD  48.58 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3258  twin-argninine leader-binding protein DmsD  48.58 
 
 		 226 aa  191  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  49.23 
 
 		 205 aa  190  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0919  twin-argninine leader-binding protein DmsD  47.64 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2252  cytoplasmic chaperone TorD family protein  47.06 
 
 		 204 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720627  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2352  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.72 
 
 		 204 aa  171  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  42.17 
 
 		 219 aa  127  8.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  43.61 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  35.71 
 
 		 211 aa  121  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02504  hypothetical protein  34.54 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00520  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  33.84 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06850  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  34.85 
 
 		 235 aa  102  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1453  cytoplasmic chaperone TorD family protein  34.36 
 
 		 198 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2719  TorD family cytoplasmic chaperone  34.72 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4654  oxidoreductase component  33.52 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1341  TorD family cytoplasmic chaperone  34.72 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0264  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.98 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1406  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.43 
 
 		 206 aa  95.5  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3679  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.53 
 
 		 237 aa  94.7  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1309  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.11 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000480203 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2921  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.27 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0348  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.44 
 
 		 219 aa  91.7  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.424165 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.5 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2184  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.75 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2610  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.61 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000111004  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2564  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.61 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.241969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2098  chaperone TorD  29.61 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2052  TorD family cytoplasmic chaperone  31.87 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2445  TorD family cytoplasmic chaperone  31.87 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2164  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.87 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.063946  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1413  chaperone, TorD family  30.56 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753019 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01032  hypothetical protein  30.56 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.77975  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1153  chaperone TorD  30.56 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120482  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1154  chaperone TorD  30.56 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1935  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.1 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161527  hitchhiker  0.00430197 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2294  chaperone, TorD family  30.56 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.250336  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01039  hypothetical protein  30.56 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4362  hypothetical protein  30 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0231  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.9 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  36.43 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1233  TorD family chaperone  29.61 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1248  chaperone, TorD family  29.61 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2053  chaperone, TorD family  29.61 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.110263  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2236  chaperone, TorD family  29.61 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.68342 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.6 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1203  chaperone, TorD family  29.05 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0356  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.93 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0328008  hitchhiker  0.00751458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1551  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.49 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.143271  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0629  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.86 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1431  hypothetical protein  29.38 
 
 		 221 aa  72  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2279  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.32 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3864  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.26 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0799961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.68 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1799  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.12 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.69 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2076  cytoplasmic chaperone TorD family protein  31.05 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.370071  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.56 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1390  cytoplasmic chaperone TorD  29.93 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  40.54 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3682  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.33 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.966559  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.57 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  0.083238 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.67 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2816  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.86 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.623005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2926  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.79 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291548  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.43 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2104  cytoplasmic chaperone  30.77 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1635  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.52 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1230  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.33 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.136646  normal  0.468317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1632  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.66 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0930  cytoplasmic chaperone TorD family protein  39.66 
 
 		 240 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.542381 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1609  cytoplasmic chaperone TorD family protein  44.64 
 
 		 284 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0546  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.86 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5493  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.13 
 
 		 235 aa  52  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  29.41 
 
 		 225 aa  51.2  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.683662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.62 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0240  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.66 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.03 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3085  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.4 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2547  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.64 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0265649  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0574  oxidoreductase component  24.34 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  25.49 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1192  cytoplasmic chaperone TorD family protein  35.71 
 
 		 285 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.563307  normal  0.32454 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.28 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2471  cytoplasmic chaperone TorD family protein  37.93 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>