133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3344 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3344  chaperone protein TorD  100 
 
 		 221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3361  chaperone protein TorD  66.82 
 
 		 215 aa  295  5e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3527  chaperone protein TorD  66.99 
 
 		 223 aa  285  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00640401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1054  chaperone protein TorD  60.29 
 
 		 209 aa  247  9e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1115  chaperone protein TorD  60.77 
 
 		 209 aa  246  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1050  chaperone protein TorD  60.29 
 
 		 209 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1153  chaperone protein TorD  59.41 
 
 		 204 aa  244  6e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3353  chaperone protein TorD  58.91 
 
 		 209 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1993  chaperone protein TorD  58.06 
 
 		 218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3214  chaperone protein TorD  58.91 
 
 		 209 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1231  chaperone protein TorD  57.89 
 
 		 217 aa  241  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3214  chaperone protein TorD  57.92 
 
 		 209 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2799  chaperone protein TorD  51.18 
 
 		 211 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.011442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1834  chaperone protein TorD  43.35 
 
 		 236 aa  188  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0986  chaperone protein TorD  33.33 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003940  chaperone protein TorD  36.36 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.282339  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01582  chaperone protein TorD  35.84 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1323  chaperone protein TorD  33.94 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0204846  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1984  chaperone protein TorD  32.27 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2644  cytoplasmic chaperone TorD family protein  33.99 
 
 		 199 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.437385  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1234  chaperone protein TorD  33.99 
 
 		 199 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.713682  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01001  chaperone protein TorD  33.99 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1109  chaperone protein TorD  33.99 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1116  chaperone protein TorD  33.99 
 
 		 199 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01008  hypothetical protein  33.99 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2597  chaperone protein TorD  33.99 
 
 		 199 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.382681 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2126  chaperone protein TorD  33.5 
 
 		 199 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2316  chaperone protein TorD  33.5 
 
 		 199 aa  94  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2732  cytoplasmic chaperone TorD family protein  32.85 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4211  chaperone protein TorD  32 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4032  chaperone protein TorD  31.5 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4049  chaperone protein TorD  32 
 
 		 210 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4104  chaperone protein TorD  31.5 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4153  chaperone protein TorD  31.5 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.39248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0215  cytoplasmic chaperone TorD family protein  30.52 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27400  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  28.02 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4217  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.61 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.154602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4691  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.36 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000065315  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1674  chaperone protein TorD  33.77 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00649542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0472  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.17 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1379  cytoplasmic chaperone TorD  24.06 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1147  cytoplasmic chaperone TorD family protein  28.76 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0493  anaerobic dehydrogenase-like protein  25.33 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.481139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2340  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.65 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79743  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3035  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.97 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0055  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.03 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0465  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.45 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.860853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2765  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.54 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1122  putative chaperone, formate dehydrogenase-specific  27.69 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04330  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  27.87 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1876  cytoplasmic chaperone TorD  25.14 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1226  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.35 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0477  anaerobic dehydrogenase-like protein  25.57 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.954599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3261  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.19 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0306986 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4104  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.46 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4222  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.46 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.46 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487402 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1209  cytoplasmic chaperone TorD family protein  26.35 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20880  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  25.35 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0115  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.88 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0339  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.53 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16920  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  22.59 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.990137 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0057  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.23 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2052  TorD family cytoplasmic chaperone  29.69 
 
 		 186 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2445  TorD family cytoplasmic chaperone  29.69 
 
 		 186 aa  53.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2164  cytoplasmic chaperone TorD family protein  29.69 
 
 		 186 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.063946  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0455  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.66 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4423  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.82 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0126  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.75 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4134  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.88 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0722  putative component of anaerobic dehydrogenase  25.9 
 
 		 186 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0768  putative anaerobic dehydrogenase component  26.62 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.723309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0649  putative component of anaerobic dehydrogenase  25.9 
 
 		 186 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4507  TorA specific chaperone, putative  25.36 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3124  cytoplasmic chaperone TorD  26.59 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3718  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.15 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0425  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.93 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1198  anaerobic dehydrogenase protein-like protein  26.34 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0387  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.88 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0291  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.23 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000755078  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3789  cytoplasmic chaperone TorD family protein  23.04 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0419  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0360  Putative anaerobic dehydrogenase-like component  26.42 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3914  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.15 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0613  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.23 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000298051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4815  cytoplasmic chaperone TorD family protein  25.98 
 
 		 230 aa  48.9  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0707  putative anaerobic dehydrogenase subunit  25.18 
 
 		 186 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.231425 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0645  cytoplasmic chaperone TorD family protein  27.34 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0663  putative component of anaerobic dehydrogenase  27.68 
 
 		 186 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1284  cytoplasmic chaperone TorD  28.57 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3047  DMSO-membrane protein  25.97 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4571  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.32 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0235  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.86 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1925  twin-argninine leader-binding protein DmsD  25.74 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1798  twin-argninine leader-binding protein DmsD  26.61 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22800  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  23.36 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1690  twin-argninine leader-binding protein DmsD  27.98 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0704301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4139  cytoplasmic chaperone TorD family protein  24.41 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0919  twin-argninine leader-binding protein DmsD  25.12 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3391  twin-argninine leader-binding protein DmsD  24.65 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>